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Enregistrement W2782324869 · doi:10.1038/s41598-017-18495-4

A novel rat CVB1-VP1 monoclonal antibody 3A6 detects a broad range of enteroviruses

2018· article· en· W2782324869 sur OpenAlexaff
Niila V. V. Saarinen, Jutta E. Laiho, Sarah J. Richardson, Marie Zeissler, Virginia M. Stone, Varpu Marjomäki, Tino Kantoluoto, Marc S. Horwitz, Amir‐Babak Sioofy‐Khojine, Anni Honkimaa, Minna M. Hankaniemi, Malin Flodström‐Tullberg, Heikki Hyöty, Vesa P. Hytönen, Olli H. Laitinen

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Immunology Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesTampereen YliopistoTekesEuropean CommissionAcademy of FinlandUniversity of Exeter
Mots-clésVirologyMonoclonal antibodyAntibodyImmunoelectron microscopyCapsidclone (Java method)BiologyCoxsackievirusPoliovirusEncephalitisEnterovirusVirusMolecular biologyImmunologyDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Enteroviruses (EVs) are common RNA viruses that cause diseases ranging from rash to paralytic poliomyelitis. For example, EV-A and EV-C viruses cause hand-foot and mouth disease and EV-B viruses cause encephalitis and myocarditis, which can result in severe morbidity and mortality. While new vaccines and treatments for EVs are under development, methods for studying and diagnosing EV infections are still limited and therefore new diagnostic tools are required. Our aim was to produce and characterize new antibodies that work in multiple applications and detect EVs in tissues and in vitro. Rats were immunized with Coxsackievirus B1 capsid protein VP1 and hybridomas were produced. Hybridoma clones were selected based on their reactivity in different immunoassays. The most promising clone, 3A6, was characterized and it performed well in multiple techniques including ELISA, immunoelectron microscopy, immunocyto- and histochemistry and in Western blotting, detecting EVs in infected cells and tissues. It recognized several EV-Bs and also the EV-C representative Poliovirus 3, making it a broad-spectrum EV specific antibody. The 3A6 rat monoclonal antibody can help to overcome some of the challenges faced with commonly used EV antibodies: it enables simultaneous use of mouse-derived antibodies in double staining and it is useful in murine models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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