Novel Structural Abnormalities Involving Chromosomes 1, 17 and 2 Identified by Fluorescence In Situ Hybridization (FISH) and/or Cytogenetic Karyotyping in Kelly and SH-SY5Y Human Neuroblastoma Cell Lines, Respectively
Notice bibliographique
Résumé
Abstract: MYCN amplification and 1p36 deletion are important poor prognostic factors in neuroblastoma. 1p36 deletion and unbalanced translocations involving chromosomes 1, 17 and 2p were often reported in neuroblastoma cell lines. We aimed to investigate novel chromosomal abnormalities that are likely to affect neuroblastoma progression in Kelly and SH-SY5Y cell lines. Therefore, we analyzed the metaphase chromosomes using fluorescence in situ hybridization (FISH) method with probes specific to the chromosome bands 2p24 and 1p36 in SH-SY5Y and Kelly, respectively. Moreover, the rearrangements of chromosomes 1 and 17 from Kelly were re-examined by cytogenetic karyotyping. FISH analysis shows duplication of chromosome 2p24 on the long arm of a partner chromosome resulted from an unbalanced translocation der(?9)t(2;?9)(p24;q?34) in SH-SY5Y, suggesting that duplication of 2p24 locus containing MYCN gene may contribute to triggering MYCN amplification in neuroblastoma. On the other hand, FISH and karyotype analyses reveal three copies of chromosome 1 that consist of an intact chromosome 1, an extra derivative chromosome 1 with terminal and interstitial deletions (:p32→q25::q41→qter), and another including only interstitial deletion (pter→q25::q41→qter), leading to monosomy of the long arm segment 1q25-q41 in Kelly. These results suggest that chromosome 1q25-q41 may contain one or more tumour suppressor genes important for neuroblastoma progression. Together, FISH analysis shows that an additional 1p36 locus in Kelly is translocated to the short arm of extra chromosome 17, where the p53 tumour suppressor gene is located. Consequently, these novel structural abnormalities involving chromosomes 1, 17 and 2 could be contributed to the tumourigenicity of neuroblastoma cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».