Abstract #3559: A quantitative survey of tyrosine phosphorylation changes with erlotinib treatment in EGFR mutant and wildtype NSCLC cell lines
Notice bibliographique
Résumé
The Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) is a transmembrane receptor that is frequently expressed in carcinoma. Erlotinib is a small molecule inhibitor of EGFR preventing the receptor9s autophosphorylation and downstream signaling. Erlotinib has been approved for second line treatment of advanced stage non-small-cell lung cancer (NSCLC) patients. NSCLC patients with mutations in the kinase domain of EGFR (L858R and exon 19 deletion) and/or EGFR gene amplifications demonstrate greater response rates and improved survival when treated by erlotinib. However, not all molecular factors that influence the clinical response to this drug are as yet identified. Greater understanding on how erlotinib influences EGFR induced cellular signaling in wild type or EGFR mutant/amplified NSCLC cells lines may provide insights on potential novel biomarkers for predicting response to erlotinib treatment, and/or novel downstream targets that may be developed against lung cancer that are resistant to erlotinib. A general quantitative survey of tyrosine phosphorylation comparing EGFR mutant, EGFR amplified wild type and EGFR low copy number wild-type NSCLC cell lines using tandem mass spectrometry (LTQ Orbitrap) was generated following erlotinib treatment, to probe differences in the impact of erlotinib on cellular phosphotyrosine targets in erlotinib-sensitive and erlotinib-resistant cell lines. Preliminary downstream effectors of erlotinib have been identified and quantified by analysis of high resolution extracted ion currents. A subset of these will be subject to validation and quantification in xenograft tumor models by using Selected Reaction Monitoring (SRM) with a triple quadrupole instrument (TSQ Quantum Ultra). (Supported by the Ontario Institute of Cancer Research Grant 07NOV-78) Citation Information: In: Proc Am Assoc Cancer Res; 2009 Apr 18-22; Denver, CO. Philadelphia (PA): AACR; 2009. Abstract nr 3559.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».