90 p16 IHC Validation on Cytology Cell Blocks
Notice bibliographique
Résumé
P16 immunohistochemistry (IHC) is a reliable surrogate marker for human papillomavirus (HPV) causation in oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPSCC) and is requested on neck FNA. However, p16 IHC is not validated on cytology cell blocks with no established interpretation guidelines. The current study compared p16 IHC in cytology and surgical specimens, to devise criteria for accurate p16 evaluation in cytology cell blocks to ensure close to 100% specificity of a positive result. p16 IHC was examined in 27 matched FNA and surgical cases of OPSCC over a two-year period. Fifty viable basaloid tumor cells in clusters were considered adequate. Both cytoplasmic and nuclear staining was evaluated. Extent of nuclear p16 staining was scored as <25%, 25%-50%, 50%-75% or >75%; intensity was scored as mild, moderate, or intense. Three of 27 were p16 negative on both the cytology and surgical specimens, and served as negative controls. The remaining 24 cases were p16 positive on the surgical specimens. Eight were excluded due to low cellularity or presence of only desquamated individual keratinized tumor cells. Six of 27 showed >75% cells with weak-intense nuclear staining. Three of 27 showed 50%-75% cells with weak-intense nuclear staining. One of 27 had weak nuclear staining in <25% cells. Three of 27 showed only weak cytoplasmic staining. Three of 27 had no nuclear or cytoplasmic staining. At least 50 viable basaloid cells in small groups should be assessed. Cells with any cytoplasmic staining should be evaluated for nuclear staining. A threshold of 25% nuclear staining results in a specificity of 100%.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».