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Enregistrement W2782660935 · doi:10.1038/s41467-018-05892-0

Uncovering the heterogeneity and temporal complexity of neurodegenerative diseases with Subtype and Stage Inference

2018· article· en· W2782660935 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensParkwood InstituteSt Joseph's Health CareMcGill UniversityUniversity of British ColumbiaToronto Western HospitalSunnybrook Health Science CentreJewish General HospitalBaycrest HospitalUniversity of TorontoWestern UniversityUniversité LavalOccupational Cancer Research CentreHealth Sciences CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesEPSRC Centre for Doctoral Training in Medical ImagingEconomic and Social Research CouncilEngineering and Physical Sciences Research CouncilNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchGenentechAssociazione Italiana Ricerca AlzheimerIXICOH. Lundbeck A/SServierUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustEisaiWolfson FoundationBrain Research TrustWeston Brain InstituteNational Institute on AgingNational Institute for Health and Care ResearchNorthern California Institute for Research and EducationPfizerBiogenBioClinicaF. Hoffmann-La RocheAlzheimer's SocietyWellcome TrustUniversity of Southern CaliforniaNovartis Pharmaceuticals CorporationU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbNational Institutes of HealthRosetrees TrustEuropean CommissionAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMedical Research CouncilMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's AssociationMichael J. Fox Foundation for Parkinson's ResearchFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésNeurodegenerationDiseaseInferenceFrontotemporal dementiaPrecision medicinePhenotypeBiologyGenetic heterogeneityNeuroscienceComputational biologyDementiaBiomarker discoveryBioinformaticsMedicineComputer scienceGeneticsArtificial intelligencePathologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The heterogeneity of neurodegenerative diseases is a key confound to disease understanding and treatment development, as study cohorts typically include multiple phenotypes on distinct disease trajectories. Here we introduce a machine-learning technique—Subtype and Stage Inference (SuStaIn)—able to uncover data-driven disease phenotypes with distinct temporal progression patterns, from widely available cross-sectional patient studies. Results from imaging studies in two neurodegenerative diseases reveal subgroups and their distinct trajectories of regional neurodegeneration. In genetic frontotemporal dementia, SuStaIn identifies genotypes from imaging alone, validating its ability to identify subtypes; further the technique reveals within-genotype heterogeneity. In Alzheimer’s disease, SuStaIn uncovers three subtypes, uniquely characterising their temporal complexity. SuStaIn provides fine-grained patient stratification, which substantially enhances the ability to predict conversion between diagnostic categories over standard models that ignore subtype ( p = 7.18 × 10 −4 ) or temporal stage ( p = 3.96 × 10 −5 ). SuStaIn offers new promise for enabling disease subtype discovery and precision medicine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,603

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle