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Enregistrement W2782758641 · doi:10.4049/jimmunol.1700677

A Subset of Human Autoreactive CD1c-Restricted T Cells Preferentially Expresses TRBV4-1+ TCRs

2017· article· en· W2782758641 sur OpenAlexafffund
Tingxi Guo, Ming Yin Koo, Yuki Kagoya, Mark Anczurowski, Chung-Hsi Wang, Kayoko Saso, Marcus O. Butler, Naoto Hirano

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyCD1T cellCell biologyCD154Natural killer T cellMolecular biologyCD40Immune systemImmunologyCytotoxic T cellGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In humans, a substantial portion of T cells recognize lipids presented by the monomorphic CD1 proteins. Recent studies have revealed the molecular basis of mycobacterial lipid recognition by CD1c-restricted T cells. Subsets of CD1c-restricted T cells recognize self-lipids in addition to foreign lipids, which may have implications in human diseases involving autoimmunity and malignancy. However, the molecular identity of these self-reactive T cells remains largely elusive. In this study, using a novel CD1c+ artificial APC (aAPC)-based system, we isolated human CD1c-restricted autoreactive T cells and characterized them at the molecular level. By using the human cell line K562, which is deficient in MHC class I/II and CD1 expression, we generated an aAPC expressing CD1c as the sole Ag-presenting molecule. When stimulated with this CD1c+ aAPC presenting endogenous lipids, a subpopulation of primary CD4+ T cells from multiple donors was consistently activated, as measured by CD154 upregulation and cytokine production in a CD1c-specific manner. These activated CD4+ T cells preferentially expressed TRBV4-1+ TCRs. Clonotypic analyses of the reconstituted TRBV4-1+ TCR genes confirmed CD1c-restricted autoreactivity of this repertoire, and the strength of CD1c reactivity was influenced by the diversity of CDR3β sequences. Finally, alanine scanning of CDR1 and CDR2 sequences of TRBV4-1 revealed two unique residues, Arg30 and Tyr51, as critical in conferring CD1c-restricted autoreactivity, thus elucidating the molecular basis of the observed V gene bias. These data provide new insights into the molecular identity of human autoreactive CD1c-restricted T cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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