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Enregistrement W2783062395 · doi:10.1094/pbiomes-12-17-0052-r

Microbial Communities Associated with Storage Onion

2018· article· en· W2783062395 sur OpenAlexafffund
Svetlana N. Yurgel, Lord Abbey, Nancy Loomer, Rosalie Gillis-Madden, Melissa Mammoliti

Notice bibliographique

RevuePhytobiomes Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGarlic and Onion Studies
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyBulbAlliumPhyllosphereBotanyPenicilliumFood spoilageMicrobial ecologyPathogenic bacteriaMicrobiologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Onion (Allium cepa) bulb rot is an important pathological problem worldwide, as it is caused by diverse pathogens, bacterial and fungal. The diversity and structure of microbial communities associated with apparently healthy and diseased onion bulbs were analyzed. The community-based approach allowed identification of a number of potential pathogenic microorganisms associated with onion bulbs affected by disease under storage environments. Enterobacteriaceae, Burkholderia, Gluconobacter, Acinetobacter, Pseudomonas, Citrobacter, Nectriaceae, Botrytis, Wickerhamomyces, Penicillium, and Candida were the most relatively abundant bacterial and fungal taxa in the diseased onion bulb dataset. It was found that these taxa are also widely distributed in the bulbs without apparent disease symptoms. Additionally, several potential fermenters were detected in onion tissue. These data suggest that, in addition to abiotic factors, fermentation plays a role in the storage spoilage of onion bulbs. It was also shown that bacterial and fungal communities differ in their diversity and structure between individual onions affected by bulb rot. The identification of dinoflagellates Symbiodinium in onion bulbs suggested that this eukaryote might have a much broader spectrum of habitats and eukaryotic hosts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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