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Enregistrement W2783070039 · doi:10.14745/ccdr.v44i01a07

Canadian recommendations for laboratory interpretation of multiple or extensive drug resistance in clinical isolates of Enterobacteriaceae, Acinetobacter species and Pseudomonas aeruginosa

2018· article· en· W2783070039 sur OpenAlexafffundvenueabout
GJ German, Matthew W. Gilmour, Graham Tipples, HJ Adam, Huda Almohri, James M. Bullard, Tanis C. Dingle, D. Farrell, Gabriel Girouard, David Haldane, Linda Hoang, P N Levett, Roberto G. Melano, Jessica Minion, Robert Needle, SN Patel, R Rennie, RC Reyes, Jean Longtin, M. R. Mulvey

Notice bibliographique

RevueCanada Communicable Disease Report · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensInstitut National de Santé Publique du QuébecSt. John’s Health Sciences CentreDr. Georges-L.-Dumont University Hospital CentreSaskatchewan HealthSaskatchewan Health AuthorityToronto Public HealthPublic Health OntarioBC Centre for Disease ControlQueen Elizabeth II Health Sciences CentreProvincial Laboratory of Public HealthSaskatchewan Disease Control LaboratoryShared HealthHealth PEI
Organismes subventionnairesUniversity of AlbertaPublic Health AgencyPublic Health Agency of CanadaMcGill University
Mots-clésInterimAntibiotic resistancePseudomonas aeruginosaPublic healthMedicineDrug resistanceBiologyMicrobiologyAntibioticsPolitical sciencePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The goal of this document was to provide Canadian laboratories with a framework for consistent reporting and monitoring of multidrug resistant organisms (MDRO) and extensively drug resistant organisms (XDRO) for common gram-negative pathogens. This is the final edition of the interim recommendations, which were modified after one year of broad consultative review. This edition represents a consensus of peer-reviewed information and was co-authored by the Canadian Public Health Laboratory Network and the Canadian Association of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. There are two main recommendations. The first recommendation provides standardized definitions for MDRO and XDRO for gram-negative organisms in clinical specimens. These definitions were limited to antibiotics that are commonly tested clinically and, to reduce ambiguity, resistance (rather than non-susceptibility) was used to calculate drug resistance status. The second recommendation identifies the use of standardized laboratory reporting of organisms identified as MDRO or XDRO. Through the broad consultation, which included public health and infection prevention and control colleagues, these definitions are ready to be applied for policy development. Both authoring organizations intend to review these recommendations regularly as antibiotic resistance testing evolves in Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,035
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,106
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,956
Score d'incertitude au seuil0,318

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0350,106
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0110,010
Études des sciences et des technologies0,0060,005
Communication savante0,0060,002
Science ouverte0,0100,003
Intégrité de la recherche0,0050,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2018
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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