Ultrasensitive DNA detection based on target-triggered rolling circle amplification and fluorescent poly(thymine)-templated copper nanoparticles
Notice bibliographique
Résumé
We describe a novel strategy for the ultrasensitive detection of target DNA based on rolling circle amplification (RCA) coupled with fluorescent poly(thymine)-templated copper nanoparticles (poly T-CuNPs). In the presence of target DNA, a padlock DNA probe that consists of two regions: a target DNA-specific region and a poly(adenine) region, is circularized by the ligation reaction, and the subsequent RCA reaction is promoted to generate long, concatemeric, single-stranded DNA (ssDNA) with a lot of repetitive poly T sequences. As a result, a large number of poly T-CuNPs are formed, exhibiting a highly fluorescent signal. However, in the absence of target DNA or in the presence of non-specific target DNA, the padlock DNA probe is not circularized and the subsequent RCA is not executed, leading to no production of fluorescent poly T-CuNPs. With this simple strategy, we successfully analyzed the target DNA with the ultralow detection limit of 7.79 aM, a value that is 3 or 7 orders of magnitude lower than those of previous RCA-based fluorescent DNA detection strategies. In addition, the developed system was demonstrated to selectively discriminate non-specific target DNAs with one-base mismatch, suggesting potential application in the accurate diagnosis of single nucleotide polymorphisms or mutations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».