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Enregistrement W2783798396 · doi:10.1093/ajcp/aqx123.227

228 Detection and Genotyping of High-Risk Human Papillomavirus in Vulvar Inverted Follicular Keratoses-like Lesions

2018· article· en· W2783798396 sur OpenAlexaboutno aff
Yiang Hui, Berlly DiazGomez, Leslie Robinson‐Bostom, Jinjun Xiong, M. Ruhul Quddus, W. Dwayne Lawrence

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Clinical Pathology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer and Skin Lesions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPathologyVulvaSex organImmunohistochemistryDermatologyVulvar neoplasmGenotypingVulvar intraepithelial neoplasiaStainingMedicineVulvar CarcinomaHuman papillomavirusBiologyInternal medicineGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The nature of inverted follicular keratoses (IFKs) is disputed, with some suggesting that they represent a variant of verruca or seborrheic keratosis. While both verruca and genital seborrheic keratoses have been associated with human papillomavirus (HPV), no HPV association has been reported in extragenital IFKs. Furthermore, vulvar IFKs have not been separately examined for HPV. We aimed to detect and compare the type-distribution of high-risk HPVs (hrHPVs) in vulvar and extragenital IFKs using a PCR-based detection method. Vulvar and extragenital IFKs from 2014 to 2016 from patients without prior history of HPV-associated lesions were identified and reviewed. Cases with greater than 90% lesional tissue were selected for DNA extraction and assessed for adequate DNA yield. Each case was assayed using the GeneNav HPV One kit (GenomeMe, Richmond, BC, Canada) for HPV16 and HPV18 with nonspecific detection of other hrHPVs. Cases demonstrating other hrHPV types were genotyped using the GeneNav HPV genotyping kit. Immunohistochemical staining for p16 and Ki67 was also performed. Twenty-six cases including four vulvar IFKs (4/26, 15.4%) meeting study criteria were identified. There were no appreciable morphologic differences between the vulvar and extragenital lesions. All four vulvar IFK cases (4/4, 100%) were positive for HPV16. Two of these were concurrently positive for HPV18 (2/4, 50%). Other hrHPV subtypes were not detected. HPV was not detected in any of the 22 extragenital IFKs. Immunohistochemical staining for p16 in all of the hrHPV-positive cases revealed strong diffuse staining with a high Ki-67 proliferation index. In contrast, the HPV-negative extragenital cases showed only patchy p16 and low K-67 expression. Although morphologically similar to extragenital non-HPV related lesions, vulvar IFKs appear to harbor hrHPVs, including HPV16, and should be considered as a previously unreported morphologic variant of high-grade vulvar intraepithelial lesion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,379
Écart entre enseignants0,342 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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