QM Study on the Mechanism of Carbonic Anhydrase II Inhibition with Glycosylcoumarin as Non-Zinc Mediated Inhibitors from Thermodynamic View Point
Notice bibliographique
Résumé
Carbonic anhydrase is an enzyme which has the zinc as the metallic part of it. This enzyme catalyzes the reversible reaction of turning carbon dioxide into bicarbonate. In this research the mechanism of inhibition a new class of inhibitor of this enzyme, glycosyl coumarin has been modeled using the density functional theory (DFT). First, the most constant confirmer of this four coumarin sugar derivatives which includes galactose, mannose, ribose and glucose has been selected and then they had been interacted as inhibitor with CA (II) enzyme’s active site. In further for showing the effect of sugar in these molecules, coumarin itself had been chosen as inhibitor and the inhibitory effect is surveyed. All calculations have been done by density functional theory in level of B3LYP with basic set 6-31G* and with Minnesota function M06 with basic set 6-31+G*. Thermodynamic functions like enthalpy of formation, entropy of formation and Gibbs free energy for CA-inhibitor have been computed. The results indicate that the reaction among these groups of inhibitors and Carbonic anhydrase is not of the type of direct and syndetic but the enzyme is deactivated with space effect and addition to this, the computed thermodynamic functions show that although this coumarin sugar derives have deterrence in the range of micro molar but, coumarin without sugar is a stronger deterrence for CA II. Finally, the interaction between the most constant confirmer (galactose coumarin) is surveyed as the best deterrence using the explicit solvent method.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».