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Enregistrement W2784100350 · doi:10.1101/240952

KMT1/Suv39 methyltransferase family regulates peripheral heterochromatin tethering via histone and non-histone protein methylations

2018· preprint· en· W2784100350 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesNational Centre for Biological SciencesThe Wellcome Trust DBT India AllianceDepartment of Biotechnology, Ministry of Science and Technology, IndiaIndian Council of Medical ResearchDirectorate for Biological SciencesTata Institute of Fundamental ResearchWellcome Trust
Mots-clésHeterochromatinHeterochromatin protein 1MethyltransferaseHistoneHistone methyltransferaseTetheringEZH2

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Euchromatic histone methyltransferases (EHMTs), members of the KMT1 family, methylate histone and non-histone proteins. Here we uncover a novel role for EHMTs in regulating heterochromatin anchorage to the nuclear periphery (NP) via non-histone (LaminB1) methylations. We show that EHMTs methylates and stabilizes LaminB1 (LMNB1), which associates with the H3K9me2-marked peripheral heterochromatin. Loss of LMNB1 methylation or EHMTs abrogates the heterochromatin anchorage from the NP. We further demonstrate that the loss of EHMTs induces many hallmarks of aging including global reduction of H3K27methyl marks along with altered nuclear-morphology. Consistent with this, we observed a gradual depletion of EHMTs, which correlates with loss of methylated LMNB1 and peripheral heterochromatin in aging human fibroblasts. Restoration of EHMT expression reverts peripheral heterochromatin defect in aged cells. Collectively our work elucidates a new mechanism by which EHMTs regulate heterochromatin domain organization and reveals their impact on fundamental changes associated with the intrinsic aging process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,059
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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