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Enregistrement W2784164757 · doi:10.1038/s41598-017-18919-1

Distinct modulation of inactivation by a residue in the pore domain of voltage-gated Na+ channels: mechanistic insights from recent crystal structures

2018· article· en· W2784164757 sur OpenAlexfundno aff
René Cervenka, Péter Lukács, Vaibhavkumar S. Gawali, Ke Song, Xaver Koenig, Lena Rubi, Touran Zarrabi, Karlheinz Hilber, Walter Sandtner, Anna Stary‐Weinzinger, Hannes Todt

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAustrian Science FundMcMaster University
Mots-clésGatingBiophysicsMutagenesisChemistryMutationLinkerIntracellularCysteineSodium channelCell biologyBiologyBiochemistrySodiumGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

channels (VGSC) is essential for the regulation of cellular excitability. The molecular rearrangement underlying inactivation is thought to involve the intracellular linker between domains III and IV serving as inactivation lid, the receptor for the lid (domain III S4-S5 linker) and the pore-lining S6 segements. To better understand the role of the domain IV S6 segment in inactivation we performed a cysteine scanning mutagenesis of this region in rNav 1.4 channels and screened the constructs for perturbations in the voltage-dependence of steady state inactivation. This screen was performed in the background of wild-type channels and in channels carrying the mutation K1237E, which profoundly alters both permeation and gating-properties. Of all tested constructs the mutation I1581C was unique in that the mutation-induced gating changes were strongly influenced by the mutational background. This suggests that I1581 is involved in specific short-range interactions during inactivation. In recently published crystal structures VGSCs the respective amino acids homologous to I1581 appear to control a bend of the S6 segment which is critical to the gating process. Furthermore, I1581 may be involved in the transmission of the movement of the DIII voltage-sensor to the domain IV S6 segment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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