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Enregistrement W2784295433 · doi:10.30699/mmlj17.1.2.50

Relevant Allelic Frequency of Gene Polymorphism and Genetic Predisposition of Human Papillomavirus in Patients with Cervical Cancer

2018· article· en· W2784295433 sur OpenAlexvenueno aff
Nikta Sajjadi, Reza Mirnejad, Malike Sharif, Vahhab Piranfar, Davood Zaeifi

Notice bibliographique

RevueModern Medical Laboratory Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlleleCervical cancerGenetic predispositionGeneticsHuman papillomavirusGeneAllele frequencyPolymorphism (computer science)BiologyCancerMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cervical Cancer Human Papillomavirus Amplification-refractory mutation system p53 gene Single Nucleotide Polymorphisms Background and Objectives: The present study investigated the correlation between p53 gene codon 72 polymorphism and 6 other genetic single nucleotide polymorphisms (SNPs) in patients with cervical cancer infected by HPV.Methods: 450 patients with cervical cancer (280 Squamous cell carcinoma and 170 Adenocarcinoma) were followed at hospitals in Iran from Dec. 2014 to Apr. 2015.Moreover, 100 age/sex-matched was used as the control group.HPV was detected by LINEAR ARRAY® HPV Genotyping Test.Allelic frequency of 6 gene polymorphisms was detected by the amplification-refractory mutation system (ARMS).Results: From 450 patients, 408 cases (90.66%) were positive for HPV.Four genotypes were observed as single infections (16, 18, 31, and 45).The most common genotypes were HPV-16 (73.52%),HPV-18 (23.28%),HPV-31 and 45 (3.17%), respectively.306 samples were arginine-arginine homozygous (70.6% and 71.4% of adenocarcinoma and squamous cell carcinoma, respectively), 70 cases were arginine-proline heterozygous (17.6% of adenocarcinoma and 23.8% of squamous cell carcinoma), and 20 cases were as proline-proline homozygous (11.8% and 4.8% of adenocarcinoma and squamous cell carcinoma, respectively). Conclusion:The prevalence of HPV was 84% and that was the estimation of the Global Burden among Iranian patients with cervical cancer (85% -99%).There was no correlation between mutations in the p53 allele and the size/type of tumors, while we found a correlation between mutations in p53 alleles and age.Therefore, XRCC1 G399A SNP and TP53 G72C SNP were significantly correlated with the cervical cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
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