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Enregistrement W2785249623

Cholangiocyte chemokine secretion and macrophage accumulation is mediated by osteopontin in murine liver models

2016· preprint· en· W2785249623 sur OpenAlexaff
Jason D. Coombes, Paul Manka, Marzena Swiderska‐Syn, Danielle Reid, Antonio Riva, Lee C. Claridge, Laurent Dollé, Rasha Younis, Marco A. Briones‐Orta, Naoto Kitamura, Kosha J. Mehta, Zhiyong Mi, Paul C. Kuo, Roger Williams, Anna Mae Diehl, Leo A. van Grunsven, Shilpa Chokshi, Ali Canbay, Frédéric Flamant, Karine Gauthier, Bertus Eksteen, Wing‐Kin Syn

Notice bibliographique

RevueHAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) · 2016
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver physiology and pathology
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOsteopontinSecretionCholangiocyteChemokineMacrophageCell biologyChemistryImmunologyInflammationBiologyMedicineInternal medicineIn vitroBiochemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background and aims Progression of chronic liver disease involves accumulation of inflammatory cells towards the peri-portal regions during a ductular inflammatory response. Osteopontin (OPN), an effector of Hh signalling, contributes to liver fibrogenesis and ductular inflammation via activation of hepatic stellate and progenitor cells. In tissue injury, OPN regulates macrophage functions via pro-inflammatory chemoattractant properties. In liver, however, the role of OPN in macrophage activation and recruitment remains unclear. We investigated the role of OPN in cholangiocyte chemokine secretion and macrophage recruitment using in vivo, in vitro, and in silico approaches. Methods In MCD and DDC murine models of liver fibrosis, total liver chemokine expression was measured by qRTPCR and macrophages detected by FACS (CD 11b, F4/80, CCR2, Ly6C). Lentiviral-mediated shRNA (shOPN) was used for OPN knockdown in murine 603B cholangiocytes, and secreted OPN neutralized by specific aptamers. Cholangiocyte chemokine secretion was measured by cytometric bead array and mRNA by qRTPCR. Macrophage migration was assessed in transwells using RAW264.7 cells. To obtain a global perspective of genes affected by OPN, next-generation RNA sequencing was used to compare control and shOPN cholan- giocytes. Transcripts were assessed in DESeq and gene ontologies and pathways by GOrilla, DAVID, and ReviGO software. Results Liver fibrosis in MCD and DDC was accompanied by upregulated total liver OPN, TGF-β, Ccl2, Ccl5, and Cxcll mRNA, and accumulation of liver CDl1b/F4/80(+) CCR2(hi) macrophages. Mice treated with OPN-aptamers had less fibrosis, reduced Ccl2, Ccl5, and Cxcll mRNA, and reduced accumulation of liver CD11b/F4/80(+) CCR2(hi) macrophages and the Ly6C(hi) inflammatory monocyte subset. In shOPN cholangiocytes, RNAseq detected 670 affected genes (Ben- jamini-Hochsberg padj <0.05). Ten chemokines were significantly downregulated: Cxcl16, Cxcl11, Cxcl10, Ccl5, Ccl2, Ccl9, Ccl7 Cxcl1, Cx3cl1 and Cxcl5 (by a range of log2fold between 2.70 and 0.99). Enriched gene ontologies clustered around immunity, chemotaxis and cytokine and chemokine production Altered pathways involved chemokine production and NfKB signalling. Consistent reductions in chemokine secretion and mRNA were verified in shOPN cholangiocytes Additionally, RAW264.7 macrophages cultured with OPN-deficient 603B conditioned media exhibited decreased migration. Conclusions In progressive liver disease OPN promotes chol- angiocyte production of chemokines and the accumulation of macrophages, including a proinflammatory monocyte subset. These data support neutralization of OPN as an anti-inflammatory and anti-fibrotic strategy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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