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Enregistrement W2785817299 · doi:10.1136/bmj.j5779

Concerns about composite reference standards in diagnostic research

2018· article· en· W2785817299 sur OpenAlexafffund
Nandini Dendukuri, Ian Schiller, Joris de Groot, Michael Libman, Karel G.M. Moons, Johannes B. Reitsma, Maarten van Smeden

Notice bibliographique

RevueBMJ · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods and Bayesian Inference
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésComposite numberImperfectReference modelReference dataComputer scienceTest (biology)StatisticsClass (philosophy)Reference valuesEconometricsData miningArtificial intelligenceMathematicsAlgorithmMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Composite reference standards are used to evaluate the accuracy of a new test in the absence of a perfect reference test. A composite reference standard defines a fixed, transparent rule to classify subjects into disease positive and disease negative groups based on existing imperfect tests. The accuracy of the composite reference standard itself has received limited attention. We show that increasing the number of tests used to define a composite reference standard can worsen its accuracy, leading to underestimation or overestimation of the new test’s accuracy. Further, estimates based on composite reference standards vary with disease prevalence, indicating that they may not be comparable across studies. These problems can be attributed to the fact that composite reference standards make a simplistic classification and then ignore the uncertainty in this classification. Latent class models that adjust for the accuracy of the different imperfect tests and the dependence between them should be pursued to make better use of data

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,777
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,873
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,223
Score d'incertitude au seuil0,275

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,7770,873
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,005
Bibliométrie0,0100,013
Études des sciences et des technologies0,0050,041
Communication savante0,0120,019
Science ouverte0,0160,013
Intégrité de la recherche0,0120,026
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,269
Tête enseignante GPT0,550
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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