The Fanconi Pathway in Pediatric T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia
Notice bibliographique
Résumé
BRCA2 (also known as FANCD1), a core component of the Fanconi pathway, suppresses transformation of immature T-cell progenitors in mice. However, whether the Fanconi pathway contributes to human T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) pathogenesis is unknown. Using targeted exon sequencing of childhood T-ALL diagnostic specimens, we found heterozygous mutations of Fanconi pathway genes in 23% of 40 cases analyzed. Array comparative genomic hybridization (CGH) analysis revealed that an additional 15% of these cases harbored large heterozygous deletions involving Fanconi pathway genes. The majority of these mutations appear to be somatic although in 2 of 8 available remission samples, the mutations were present, suggestive that these mutations are likely to be germline. Fanconi genes are typically considered two-hit tumor suppressors, where breast or ovarian cancers arising in heterozygous carriers often lose activity of the wild-type allele, leading to genomic instability. However, T-ALL cases with heterozygous Fanconi mutations lacked evidence of increased genomic instability based on array CGH analysis, were not hypersensitive to the PARP inhibitor olaparib, and did not demonstrate increased radial chromosome formation in response to mitomycin C (MMC), indicating that these cases retained activity of the wild-type allele. Complementation studies of Fanconi mutant cells revealed that most of the identified Fanconi mutations encoded pathogenic alleles, as evidenced by their impaired ability to rescue Fanconi-deficient cells from mitomycin C-induced radial chromosome formation and cytotoxicity. Treatment of a patient-derived xenograft sample harboring a heterozygous BRCA2 mutation with mitomycin C revealed that these cells had an intermediate increase in sensitivity to mitomycin C-induced cytotoxicity compared to Fanconi wild-type T-ALLs, suggesting that Fanconi haploinsufficiency is pathogenic in T-ALL. Together, these findings implicate a tumor suppressor role for Fanconi pathway haploinsufficiency in childhood T-ALL. Disclosures Hunger: Jazz Pharmaceuticals: Honoraria; Novartis: Consultancy; Amgen: Consultancy, Equity Ownership; Erytech Pharmaceuticals: Consultancy. Neuberg: Synta Pharmaceuticals: Other: Stock shares.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».