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Enregistrement W2786405572 · doi:10.1136/jmedgenet-2017-104882

Evidence for genetic anticipation in vonHippel-Lindau syndrome

2018· article· en· W2786405572 sur OpenAlexaff
Laura Aronoff, David Malkin, Kalene van Engelen, Bailey Gallinger, Jonathan D. Wasserman, Raymond H. Kim, Anita Villani, M. Stephen Meyn, Harriet Druker

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensSickKids FoundationPrincess Margaret Cancer CentreHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTelomereAnticipation (artificial intelligence)Somatic cellBiologyAlleleFluorescence in situ hybridizationOncologyMedicineGeneticsInternal medicineChromosomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background von Hippel-Lindau (vHL) syndrome is a rare autosomal-dominant disorder that confers a lifelong risk for developing both benign and malignant tumours in multiple organs. Recent evidence suggests that vHL may exhibit genetic anticipation (GA). The aim of this study was to determine if GA occurs in vHL, and if telomere shortening may be a factor in GA. Methods A retrospective chart review of vHL families seen at The Hospital for Sick Children between 1984 and 2016 was performed. Age of onset (AOO, defined as the age of first physician-diagnosed vHL-related manifestation) was confirmed for 96 patients from 20 unrelated families (80 clinically affected and 16 unaffected carriers). Flow-FISH(flow cytometry sorting of cells whose telomeres are labeled by Fluorescence In Situ Hybridization) was used to measure mean telomere length of six white blood cell subtypes from 14 known VHL pathogenic variant carriers. Results The median AOO for generations I, II and III were 32.5, 22.5 and 12.0 years, respectively. The differences in the AOO between generations were highly significant using a Cox proportional hazards model (P=6.00×10 -12 ). Telomere lengths were significantly different for granulocytes and natural killer lymphocytes of patients with vHL compared with age-matched controls. For six vHL parent–child pairs, median white blood cell telomere lengths between parent and child were not significantly different. Conclusions Our results suggest that vHL telomere abnormalities may be primarily somatic in origin rather than a cause of GA. As tumour development exhibits GA in our cohort, vHL surveillance guidelines may need to account for a patient’s generational position within a vHL pedigree.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,510
Score d'incertitude au seuil0,423

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,362
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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