MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2786452152 · doi:10.4049/jimmunol.1701377

CCR8 Expression Defines Tissue-Resident Memory T Cells in Human Skin

2018· article· en· W2786452152 sur OpenAlexaff
Michelle L. McCully, Kristin Ladell, Robert Andrews, Rhiannon E. Jones, Kelly L. Miners, Lauréline Roger, Duncan M. Baird, Mark J. Cameron, Zita M. Jessop, Iain S. Whitaker, Eleri Davies, David A. Price, Bernhard Moser

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMedical Research CouncilCancer Research UKWellcome Trust
Mots-clésBiologyT cellT-cell receptorCell biologyIL-2 receptorReceptorChemokineImmunologyMolecular biologyImmune systemGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Human skin harbors two major T cell compartments of equal size that are distinguished by expression of the chemokine receptor CCR8. In vitro studies have demonstrated that CCR8 expression is regulated by TCR engagement and the skin tissue microenvironment. To extend these observations, we examined the relationship between CCR8+ and CCR8− skin T cells in vivo. Phenotypic, functional, and transcriptomic analyses revealed that CCR8+ skin T cells bear all the hallmarks of resident memory T cells, including homeostatic proliferation in response to IL-7 and IL-15, surface expression of tissue localization (CD103) and retention (CD69) markers, low levels of inhibitory receptors (programmed cell death protein 1, Tim-3, LAG-3), and a lack of senescence markers (CD57, killer cell lectin-like receptor subfamily G member 1). In contrast, CCR8− skin T cells are heterogeneous and comprise variable numbers of exhausted (programmed cell death protein 1+), senescent (CD57+, killer cell lectin-like receptor subfamily G member 1+), and effector (T-bethi, Eomeshi) T cells. Importantly, conventional and high-throughput sequencing of expressed TCR β-chain (TRB) gene rearrangements showed that these CCR8-defined populations are clonotypically distinct, suggesting unique ontogenies in response to separate antigenic challenges and/or stimulatory conditions. Moreover, CCR8+ and CCR8− skin T cells were phenotypically stable in vitro and displayed similar levels of telomere erosion, further supporting the likelihood of a nonlinear differentiation pathway. On the basis of these results, we propose that long-lived memory T cells in human skin can be defined by the expression of CCR8.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations94
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of ImmunologyMême sujetT-cell and B-cell ImmunologyTravaux en français237 207