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Enregistrement W2786620531 · doi:10.1139/cjps-2017-0204

Detection of QTL underlying seed quality components in soybean [<i>Glycine max</i> (L.) Merr.]

2018· article· en· W2786620531 sur OpenAlexvenueno aff
Masum Akond, Jiazheng Yuan, Shiming Liu, Stella K. Kantartzi, Khalid Meksem, Nacer Bellaloui, David A. Lightfoot, My Abdelmajid Kassem

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoybean genetics and cultivation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgricultural Research ServiceU.S. Department of AgricultureU.S. Department of Defense
Mots-clésQuantitative trait locusBiologyPopulationGeneticsGlycinePalmitic acidInbred strainSingle-nucleotide polymorphismFatty acidAmino acidGeneGenotypeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Improving seed composition and quality, including protein, oil, fatty acid, and amino acid contents, is an important goal of soybean farmers and breeders. The aim of this study was to map the quantitative trait loci (QTL) underlying the contents of protein, oil, fatty acids, and amino acids with 1510 single nucleotide polymorphism (SNP) markers using the ‘Hamilton’ × ‘Spencer’ recombinant inbred line population (H × S; n = 93). A total of 13 QTL for the traits studied have been mapped on 3 chromosomes (Chr.) of the soybean genome. Three major QTL have been mapped to a 7–13 cM region on Chr. 6. One major QTL for oil content (qOIL001) explained approximately 76% of the total phenotypic variation in this population; the second major QTL for amino acid alanine (Ala; qALA001) explained approximately 74% of the total variation in Ala content; moreover, two major QTL for palmitic acid (qPAL001 and qPAL002) were identified on Chr. 6 and explained approximately 21% of the phenotypic variation in this population. The SNP markers flanking the QTL identified here will be very useful for soybean breeders to develop and select soybean lines with higher seed composition qualities using marker-assisted selection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,901
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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