The scaffolding protein JADE1 physically links the acetyltransferase subunit HBO1 with its histone H3–H4 substrate
Notice bibliographique
Résumé
The human enzyme histone acetyltransferase binding to ORC1 (HBO1) regulates DNA replication, cell proliferation, and development. HBO1 is part of a multiprotein histone acetyltransferase (HAT) complex that also contains inhibitor of growth family member (ING) 4/5, MYST/Esa1-associated factor (MEAF) 6, and the scaffolding proteins Jade family PHD finger (JADE) 1/2/3 or bromodomain and PHD finger-containing protein (BRPF) 2/3 to acetylate histone H4 H4K5/8/12 or H3K14, respectively. Within this four-protein complex, JADE1 determines histone H4 substrate specificity of the HBO1–HAT complex. However, the mechanism by which JADE1 controls the H4-specific acetyltransferase activity of HBO1 is unknown. Here we used recombinant proteins in vitro to dissect the specific regions and activities of HBO1 and JADE1 that mediate histone H3–H4 acetylation via the HBO1-HAT domain. We found that JADE1 increases the catalytic efficiency of HBO1 acetylation of an H3–H4 substrate by about 5-fold through an N-terminal, 21-residue HBO1- and histone-binding domain and a nearby second histone core–binding domain. We also demonstrate that HBO1 contains an N-terminal histone-binding domain (HBD) that makes additional contacts with H3–H4 independent of JADE1 interactions with histones and that the HBO1 HBD does not significantly contribute to HBO1's overall HAT activity. Experiments with JADE1 deletions in vivo recapitulated these in vitro interactions and their roles in HBO1 histone acetylation activity. Together, these results indicate that the N-terminal region of JADE1 functions as a platform that brings together the catalytic HBO1 subunit with its cognate H3–H4 substrate for histone acetylation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».