Molecular basis for the structural diversity in serogroup O2-antigen polysaccharides in Klebsiella pneumoniae
Notice bibliographique
Résumé
Klebsiella pneumoniae is a major health threat. Vaccination and passive immunization are considered as alternative therapeutic strategies for managing Klebsiella infections. Lipopolysaccharide O antigens are attractive candidates because of the relatively small range of known O-antigen polysaccharide structures, but immunotherapeutic applications require a complete understanding of the structures found in clinical settings. Currently, the precise number of Klebsiella O antigens is unknown because available serological tests have limited resolution, and their association with defined chemical structures is sometimes uncertain. Molecular serotyping methods can evaluate clinical prevalence of O serotypes but require a full understanding of the genetic determinants for each O-antigen structure. This is problematic with Klebsiella pneumoniae because genes outside the main rfb (O-antigen biosynthesis) locus can have profound effects on the final structure. Here, we report two new loci encoding enzymes that modify a conserved polysaccharide backbone comprising disaccharide repeat units [→3)-α-d-Gal p -(1→3)-β-d-Gal f -(1→] (O2a antigen). We identified in serotype O2aeh a three-component system that modifies completed O2a glycan in the periplasm by adding 1,2-linked α-Gal p side-group residues. In serotype O2ac, a polysaccharide comprising disaccharide repeat units [→5)-β-d-Gal f -(1→3)-β-d-Glc p NAc-(1→] (O2c antigen) is attached to the non-reducing termini of O2a-antigen chains. O2c-polysaccharide synthesis is dependent on a locus encoding three glycosyltransferase enzymes. The authentic O2aeh and O2c antigens were recapitulated in recombinant Escherichia coli hosts to establish the essential gene set for their synthesis. These findings now provide a complete understanding of the molecular genetic basis for the known variations in Klebsiella O-antigen carbohydrate structures based on the O2a backbone.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».