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Enregistrement W2787680898 · doi:10.1371/journal.ppat.1006759

Animal TSEs and public health: What remains of past lessons?

2018· article· en· W2787680898 sur OpenAlexfundno aff
Saima Zafar, Mohsin Shafiq, Olivier Andréoletti, Inga Zerr

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDeutsches Zentrum für Neurodegenerative ErkrankungenAgence Nationale de la RechercheHelmholtz-Alberta InitiativeEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease Research
Mots-clésPRNPBovine spongiform encephalopathyChronic wasting diseaseBiologyVirologyScrapieGenotypeInfectivityTransmissible spongiform encephalopathyDiseaseTransmission (telecommunications)PopulationGeneticsPrion proteinVirusGeneMedicinePathologyEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transmissible spongiform encephalopathies (TSEs) or prion diseases of animals include scrapie in sheep and goat, chronic wasting disease (CWD) in cervids (including mule deer, whitetailed deer, moose, elk, and reindeer), and bovine spongiform encephalopathy (BSE) in cattle; these diseases are either classical/naturally occurring or atypical forms and are thought to be caused by the spontaneous misfolding of prion protein.Marked heterogeneity with respect to clinicopathological features, susceptibility, and infectivity is known across and within the species, but the molecular basis for that phenomenon is still not completely understood, except for some factors.In most species, susceptibility to the disease is strongly influenced by the polymorphism in prion protein encoding gene (PRNP).In humans, the dimorphism at PRNP codon 129 (substitution of valine for methionine) impacts both the susceptibility and the phenotypes of TSEs [1].However, sheep with Q171R genotype show maximum resistance, and A136V genotype animals show maximum susceptibility to develop scrapie [2], and a single amino acid modification alters TSEs cross-species transmissions [3].Concerns and speculation about cross-species transmission of TSEs-particularly transmission of animal TSEs to humans-have existed since the infectious nature of these diseases was demonstrated, but there was no evidence of zoonotic transmission until the link between BSE and a novel human TSE (variant CJD or vCJD) was established in the late 1990s.While the number of vCJD clinical cases identified so far remains low, several studies suggested that 1 out of 2,000 individuals could be vCJD infected but asymptomatic in the United Kingdom population [4].In Europe, the emergence of vCJD triggered a major sanitary crisis that resulted in the implementation of a strong and coherent policy (EU regulation 999/2001) that aimed at eradicating animal TSEs.As a consequence of this policy, the BSE epidemic has nearly faded, and the EU authorities started to dismantle this policy.This change in the EU TSE doctrine raises questions about the necessity and the means to effectively protect human consumers from exposure to animals' prions. Cattle BSEsClassical BSE (C-BSE) was first recognized in 1984-85 as novel TSE affecting cattle in the UK [5].The epidemics caused about 180,000 clinical cases, and it was estimated that about 400,000 infected animals might have entered the food chain.BSE cases have been identified in Europe and in many other countries including United States of America, Canada, and Japan (Fig 1A & 1B).The National CJD Surveillance Unit UK has estimated that over 1 million infected cattle entered the human food chain [6].The origin of the BSEs has still not been clearly established, but the number of cases was amplified by the recycling of animal carcasses into cattle feed [7].The overwhelming weight of

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,012
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,022
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,066

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0120,022
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0020,009
Communication savante0,0080,015
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0100,010
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0170,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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