MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2787697704 · doi:10.7554/elife.35034

Translational control of ERK signaling through miRNA/4EHP-directed silencing

2018· article· en· W2787697704 sur OpenAlexafffund
Seyed Mehdi Jafarnejad, Clément Chapat, Edna Matta‐Camacho, Idit Anna Gelbart, Geoffrey G. Hesketh, Meztli Arguello, Aitor Garzia, Sung‐Hoon Kim, Jan Attig, Maayan Shapiro, Masahiro Morita, Arkady Khoutorsky, Tommy Alain, Christos G. Gkogkas, Noam Stern‐Ginossar, Thomas Tuschl, Anne‐Claude Gingras, Thomas F. Duchaîne, Nahum Sonenberg

Notice bibliographique

RevueeLife · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of OttawaSinai Health SystemLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteChildren's Hospital of Eastern OntarioMcGill University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaParkinson Canada
Mots-clésGene silencingmicroRNAEffectorCell biologyRNA-induced silencing complexBiologyArgonauteTranslation (biology)Regulation of gene expressionMAPK/ERK pathwayRibosome profilingDUSP6Gene expressionRNA interferencePsychological repressionMessenger RNAGenePhosphataseSignal transductionPhosphorylationGeneticsRNAProtein phosphatase 2Non-coding RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MicroRNAs (miRNAs) exert a broad influence over gene expression by directing effector activities that impinge on translation and stability of mRNAs. We recently discovered that the cap-binding protein 4EHP is a key component of the mammalian miRNA-Induced Silencing Complex (miRISC), which mediates gene silencing. However, little is known about the mRNA repertoire that is controlled by the 4EHP/miRNA mechanism or its biological importance. Here, using ribosome profiling, we identify a subset of mRNAs that are translationally controlled by 4EHP. We show that the Dusp6 mRNA, which encodes an ERK1/2 phosphatase, is translationally repressed by 4EHP and a specific miRNA, miR-145. This promotes ERK1/2 phosphorylation, resulting in augmented cell growth and reduced apoptosis. Our findings thus empirically define the integral role of translational repression in miRNA-induced gene silencing and reveal a critical function for this process in the control of the ERK signaling cascade in mammalian cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,366

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueeLifeMême sujetMicroRNA in disease regulationTravaux en français237 207