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Enregistrement W2787947681 · doi:10.1111/1755-0998.12764

Spatial dynamics and mixing of bluefin tuna in the Atlantic Ocean and Mediterranean Sea revealed using next‐generation sequencing

2018· article· en· W2787947681 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology Resources · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIdentification and Quantification in Food
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesNational Marine Fisheries ServiceEuskal Herriko UnibertsitateaSoutheast Fisheries Science CenterUniversiteit GentEuropean CommissionNational Oceanic and Atmospheric AdministrationU.S. Department of Commerce
Mots-clésBiologyMediterranean seaAtlantic codTunaGenotypingPopulationMediterranean BasinMediterranean climateFisheryOceanographyEcologyGadusGenotypeGeneticsDemographyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The Atlantic bluefin tuna is a highly migratory species emblematic of the challenges associated with shared fisheries management. In an effort to resolve the species’ stock dynamics, a genomewide search for spatially informative single nucleotide polymorphisms ( SNP s) was undertaken, by way of sequencing reduced representation libraries. An allele frequency approach to SNP discovery was used, combining the data of 555 larvae and young‐of‐the‐year ( LYOY ) into pools representing major geographical areas and mapping against a newly assembled genomic reference. From a set of 184,895 candidate loci, 384 were selected for validation using 167 LYOY . A highly discriminatory genotyping panel of 95 SNP s was ultimately developed by selecting loci with the most pronounced differences between western Atlantic and Mediterranean Sea LYOY . The panel was evaluated by genotyping a different set of LYOY ( n = 326), and from these, 77.8% and 82.1% were correctly assigned to western Atlantic and Mediterranean Sea origins, respectively. The panel revealed temporally persistent differentiation among LYOY from the western Atlantic and Mediterranean Sea ( F ST = 0.008, p = .034). The composition of six mixed feeding aggregations in the Atlantic Ocean and Mediterranean Sea was characterized using genotypes from medium ( n = 184) and large ( n = 48) adults, applying population assignment and mixture analyses. The results provide evidence of persistent population structuring across broad geographic areas and extensive mixing in the Atlantic Ocean, particularly in the mid‐Atlantic Bight and Gulf of St. Lawrence. The genomic reference and genotyping tools presented here constitute novel resources useful for future research and conservation efforts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,368
Score d'incertitude au seuil0,366

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle