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Enregistrement W2788397352 · doi:10.1136/bmjopen-2017-017578

Blood-based biomarkers of cancer-related cognitive impairment in non-central nervous system cancer: protocol for a scoping review

2018· review· en· W2788397352 sur OpenAlexafffund
Samantha Mayo, John Kuruvilla, Rob C. Laister, Ana Patricia Ayala, Mark W Alm, Will Byker, Debra Lynch Kelly, Leorey N. Saligan

Notice bibliographique

RevueBMJ Open · 2018
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related cognitive impairment studies
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesUniversity of Toronto
Mots-clésMedicineCognitive impairmentCancerProtocol (science)CognitionCentral nervous systemNeurologyBioinformaticsPathologyAlternative medicineInternal medicinePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Cancer-related cognitive impairment (CRCI) can have detrimental effects on quality of life, even among patients with non-central nervous system (CNS) cancers. Several studies have been conducted to explore different markers associated with CRCI to understand its pathobiology. It is proposed that the underlying mechanisms of CRCI are related to a cascade of physiological adaptive events in response to cancer and/or treatment. Hence, peripheral blood would be a logical source to observe and identify these physiological events. This paper outlines the protocol for a scoping review being conducted to summarise the extant literature regarding blood-based biomarkers of CRCI among patients with non-CNS cancer. METHODS/ANALYSIS: Methods will be informed by the updated guidelines of Arksey and O'Malley. The systematic search for literature will include electronic databases, handsearching of key journals and reference lists, forward citation tracking and consultation with content experts. Study selection will be confirmed by duplicate review and calculation of inter-rater reliability. Data to be charted will include study design, sample size, cancer and treatment characteristics, demographic characteristics, cognitive variable/s and biomarkers assessed, associations between cognitive functioning and biomarkers (including statistics used), and rigour in biomarker sample collection and processing. Results will be presented through: (1) a descriptive numerical summary of studies, including a flow diagram based on the Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-analyses statement, (2) a list of blood-based biomarkers associated with CRCI and (3) a narrative overview developed through collaboration among the research team and consultation with content experts. DISSEMINATION: The findings of this review will highlight current directions and gaps in the current body of evidence that may lead to improved rigour in future CRCI investigations. The dissemination of this work will be facilitated through the involvement of clinicians and researchers on the research team, an external consultation process and the presentation of the results through scholarly publication and presentation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Protocole
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Revue systématiquelow
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Protocole
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Revue systématiquehigh
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,090
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,111
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,090
Score d'incertitude au seuil0,478

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0900,111
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0050,004
Méta-épidémiologie (sens large)0,0110,016
Bibliométrie0,0140,014
Études des sciences et des technologies0,0040,004
Communication savante0,0080,008
Science ouverte0,0050,007
Intégrité de la recherche0,0090,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0680,013

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,130
Tête enseignante GPT0,509
Écart entre enseignants0,380 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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