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Enregistrement W2789098050 · doi:10.3138/jammi.2.2.03

Susceptibility profiles of nutritionally variant streptococci (NVS) recovered from invasive cases in Ontario, Canada

2018· article· en· W2789098050 sur OpenAlexaffvenueabout
Samir N. Patel, Alex Marchand‐Austin, Heather Siebert, Faheem Siddiqi, Deidre Soares, Julianne V. Kus

Notice bibliographique

RevueJournal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfective Endocarditis Diagnosis and Management
Établissements canadiensPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPenicillinEndocarditisMicrobiologyAntibioticsCephalosporinMedicineInfective endocarditisInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Both Abiotrophia spp and Granulicatella spp have been shown to cause invasive infections, including endocarditis. Historically, these organisms were commonly referred to as nutritionally variant streptococci (NVS), as they were challenging to culture and required special media supplements for growth in vitro. Current guidelines for the management of endocarditis caused by NVS suggest treating patients with beta-lactams, particularly benzylpenicillin, but data supporting this recommendation are sparse and do not differentiate antibiotic treatment between the two species. Objective: To determine susceptibility profiles of Abiotrophia spp and Granulicatella spp recovered from invasive infections. Results: Between January 2010 and June 2015, 219 clinical isolates of NVS were submitted to the Public Health Ontario Laboratory for identification and/or susceptibility testing. The majority of these isolates (162/219; 74%) were recovered from blood cultures. Granulicatella spp showed greater susceptibility to penicillin than Abiotrophia spp (65.4% versus 23.7%). On the other hand, Abiotrophia spp isolates showed greater susceptibility to third- and fourth-generation cephalosporins than Granulicatella spp. Both Abiotrophia spp and Granulicatella spp isolates were universally susceptible to vancomycin. Conclusion: The findings demonstrate that susceptibility of NVS to commonly recommended antimicrobials depends on genus with Granulicatella spp exhibiting higher susceptibility to penicillin (the commonly recommended treatment for endocarditis caused by NVS) than Abiotrophia spp. Therefore, accurate identification and routine susceptibility testing of NVS would improve effective management of patients with invasive infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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