Susceptibility profiles of nutritionally variant streptococci (NVS) recovered from invasive cases in Ontario, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Background: Both Abiotrophia spp and Granulicatella spp have been shown to cause invasive infections, including endocarditis. Historically, these organisms were commonly referred to as nutritionally variant streptococci (NVS), as they were challenging to culture and required special media supplements for growth in vitro. Current guidelines for the management of endocarditis caused by NVS suggest treating patients with beta-lactams, particularly benzylpenicillin, but data supporting this recommendation are sparse and do not differentiate antibiotic treatment between the two species. Objective: To determine susceptibility profiles of Abiotrophia spp and Granulicatella spp recovered from invasive infections. Results: Between January 2010 and June 2015, 219 clinical isolates of NVS were submitted to the Public Health Ontario Laboratory for identification and/or susceptibility testing. The majority of these isolates (162/219; 74%) were recovered from blood cultures. Granulicatella spp showed greater susceptibility to penicillin than Abiotrophia spp (65.4% versus 23.7%). On the other hand, Abiotrophia spp isolates showed greater susceptibility to third- and fourth-generation cephalosporins than Granulicatella spp. Both Abiotrophia spp and Granulicatella spp isolates were universally susceptible to vancomycin. Conclusion: The findings demonstrate that susceptibility of NVS to commonly recommended antimicrobials depends on genus with Granulicatella spp exhibiting higher susceptibility to penicillin (the commonly recommended treatment for endocarditis caused by NVS) than Abiotrophia spp. Therefore, accurate identification and routine susceptibility testing of NVS would improve effective management of patients with invasive infections.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».