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Enregistrement W2789170867 · doi:10.1186/s40643-018-0189-5

Exotic glycerol dehydrogenase expressing Escherichia coli increases yield of 2,3-butanediol

2018· article· en· W2789170867 sur OpenAlexafffund
Md. Shafiqur Rahman, Chunbao Xu, Wensheng Qin

Notice bibliographique

RevueBioresources and Bioprocessing · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensWestern UniversityLakehead University
Organismes subventionnairesLakehead UniversityBioFuelNet Canada
Mots-clés2,3-ButanediolEscherichia coliShuttle vectorGlycerolKlebsiella pneumoniaeBiologyMicrobiologyRecombinant DNAMetabolic engineeringBiochemistryChemistryGeneFermentationVector (molecular biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The thriving of biodiesel industry has led to produce 10% (v/v) crude glycerol, thus creating an overflow problem. Biofuel production is restricted by Escherichia coli due to its toxicity to bacterial cells. Therefore, a platform chemical and fuel additive 2,3-butanediol (2,3-BD) with low toxicity to microbes could be a promising alternative for biofuel production by recombinant E. coli using glycerol as the sole substrate. A novel expression system of E. coli was developed to express the dhaD gene encoding glycerol dehydrogenase (GDH) to produce value-added metabolic products through aerobic biotransformation of glycerol. The dhaD gene obtained from Klebsiella pneumoniae SRP2 was expressed in E. coli BL21(DE3)pLysS using an E. coli–K. pneumoniae shuttle vector pJET1.2/blunt consisting of chloramphenicol-resistance gene under the control of the T7lac promotor. RT-PCR analysis and dhaD overexpression confirmed that the 2,3-BD synthesis pathway gene was expressed on RNA and protein levels. Therefore, the recombinant E. coli exhibited a 38.9-fold higher enzyme activity (312.57 units/mg protein), yielding 8.97 g/L 2,3-BD, a 2.4-fold increase with respect to the non-recombinant strain. The engineered strain E. coli BL21(DE3)pLysS/pJET1.2/blunt-dhaD, carrying the 2,3-BD pathway gene dhaD from our newly isolated Klebsiella pneumoniae SRP2 strain, displayed the best ability to synthesize 2,3-BD from low-cost biomass glycerol. The value of expression of an important glycerol metabolism gene dhaD is the highest ever achieved with an engineered E. coli strain. From these results, the first reported dhaD expression system has paved the way for improvement of 2,3-BD production and is efficient for another heterologous gene expression in E. coli.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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