Nuclear genome size variation in the allopolyploid <i>Onosma arenaria</i> – <i>O. pseudoarenaria</i> species group: methodological issues and revised data
Notice bibliographique
Résumé
We used flow cytometry (FCM) to investigate genome size variation in two polymorphic allopolyploids, Onosma arenaria Waldst. and Kit. and O. pseudoarenaria Schur, in Central Europe and the Balkan Peninsula. An intercalating DNA stain, propidium iodide (PI), and internal standardization were used. Our data showed that cytosolic compounds may be present in FCM samples and could inhibit, or more frequently promote, PI intercalation. In the absence of PI intercalation interference, leaf-based genome size estimates were observed to be lower than seed-based ones in O. pseudoarenaria, whereas no difference was recorded in O. arenaria. In incubation tests, genome size values frequently increase after a longer staining period. For final genome size measurements, we applied the FCM protocol based on seed material using a ∼150 min incubation period, and provide evidence of mean genome size variation among populations of both species. Two and four natural genome size groups were revealed in O. arenaria and O. pseudoarenaria respectively. Group mean genome sizes varied considerably in both O. arenaria (5.36–5.76 pg) and O. pseudoarenaria (5.98–6.58 pg). This extensive genome size variation is attributed to unexplored taxonomic heterogenity in both taxa. Future taxonomic revision of the group may be supported with genome size measurements obtained using an appropriately standardized methodology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».