Comparison of Practice Guidelines, BRCAPRO, and Genetic Counselor Estimates to Identify Germline <i>BRCA1</i> and <i>BRCA2</i> Mutations in Pancreatic Cancer
Notice bibliographique
Résumé
Germline BRCA1 and BRCA2 (BRCA) mutation carriers with pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) may benefit from precision therapies and their relatives should undergo tailored cancer prevention. In this study, we compared strategies to identify BRCA carriers with PDAC. Incident cases of PDAC were prospectively recruited for BRCA sequencing. Probands were evaluated using the National Comprehensive Cancer Network (NCCN) and the Ontario Ministry of Health and Long-Term Care (MOHLTC) guidelines. The probability of each proband carrying a mutation was estimated by surveying genetic counselors and using BRCAPRO. BRCA mutations were detected in 22/484 (4.5%) probands. 152/484 (31.2%) and 16/484 (3.3%) probands met the NCCN and MOHLTC guidelines, respectively. The NCCN guidelines had higher sensitivity than the MOHLTC guidelines (0.864 versus 0.227, P < 0.001) but lower specificity (0.712 versus 0.976, P < 0.001). One hundred and nineteen genetic counselors completed the survey. Discrimination was similar between genetic counselors and BRCAPRO (area-under-the-curve: 0.755 and 0.775, respectively, P = 0.702). Genetic counselors generally overestimated (P = 0.008), whereas BRCAPRO severely underestimated (P < 0.001), the probability that each proband carried a mutation. Our results indicate that the NCCN guidelines and genetic counselors accurately identify BRCA mutations in PDAC, while the MOHLTC guidelines and BRCAPRO should be updated to account for the association between BRCA and PDAC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».