A250 HNF4A’S NEW ROLE IN DNA REPAIR COULD BE A POTENTIAL THERAPEUTIC TARGET FOR COLORECTAL CANCER TREATMENT
Notice bibliographique
Résumé
Colorectal carcinomas typically feature an upregulation of the P2 isoform class of HNF4α. The expression of P2-HNF4α correlates with cell proliferation. Despite this link, the functional role that P2-HNF4α plays in the phenotype of colorectal cancer is poorly understood. Recently, we demonstrated that P2-HNF4α is involved in DNA repair by forming complexes with DNA repair proteins. Drugs specifically targeting DNA repair proteins have become promising avenues for treatment of colorectal cancer as of late. The goal of our study was to determine whether the newly demonstrated link between P2-HNF4α and DNA repair proteins could potentially be exploited for colorectal cancer treatment. The complexes of interaction of P2-HNF4α were identified by quantitative proteomics (GFP-Trap and BioID). Immunofluorescence showed HNF4α’s colocalization to foci of DNA damage (γH2AX). The efficiency of non-homologous end-joining (NHEJ) was quantified by flow cytometry using a GFP reporter system. Finally, the effect of a PARP inhibitor (olaparib) coupled to knocked down P2-HNF4α expression (shRNA) will be observed. In total, 1066 proteins were identified, by BioID or GFP-Trap, as cofactors of P2-HNF4α. Through BioID, 1007 cofactors of P2-HNF4α were identified in the 293T and HCT116 cell lines, and 59 cofactors were identified in the 293T cell line through GFP-Trap. Many common targets are known to be involved in DNA repair and also cancerous mechanisms. Some common DNA repair targets, p53, PARP1, Rad50, and DNA-PK, were then shown to interact with endogenous P2-HNF4α in HT-29 and LoVo cells. Following genotoxic stress, induced by micro-irradiation or etoposide, immunofluorescence revealed that P2-HNF4α colocalizes to DNA damage loci (γH2AX) in the nucleus of HT-29 and LoVo colorectal cancerous cell lines. Furthermore, we observed a 35% decrease in efficiency of non-homologous end joining in 293 cells where P2-HNF4α was overexpressed. The effect of olaparib on NHEJ and concomitant P2-HNF4α loss will be quantified as well. For the first time, we demonstrated the functional involvement of P2-HNF4α in NHEJ. Furthermore, HNF4α’s involvement in DNA repair is a previously undescribed non-transcriptional role for the transcription factor. Studies are currently underway to determine whether this link between P2-HNF4α and DNA repair could be exploitable in the context of colorectal cancer. CIHRNSERC
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».