MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2789646484 · doi:10.1101/252783

Guiding Vaccine Efficacy Trial Design During Public Health Emergencies: An interactive web-based decision support tool

2018· preprint· en· W2789646484 sur OpenAlexaff
Steven E. Bellan, Rosalind M. Eggo, Pierre‐Stéphane Gsell, Adam J. Kucharski, Natalie E. Dean, Richard G. Donohue, Matt Zook, Frank Odhiambo, Ira M. Longini, Marc Brisson, Barbara E. Mahon, Ana María Henao-Restrepo

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBlueprintClinical study designDecision aidsComputer scienceDecision support systemPublic healthPopulationManagement scienceMedicineKnowledge managementClinical trialData scienceEngineeringNursingEnvironmental healthArtificial intelligenceAlternative medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The design and execution of rigorous, fast, and ethical vaccine efficacy trials can be challenging during epidemics of emerging pathogens, such as the 2014-2016 Ebola virus and 2015-2016 Zika virus epidemics. Response to an urgent public health crisis requires accelerated research even as emerging epidemics themselves change rapidly and are inherently less well understood than well-established diseases. As part of the World Health Organization Research and Development Blueprint, we designed a web-based interactive decision support system (InterVax-Tool) to help diverse stakeholders navigate the epidemiological, logistical, and ethical decisions involved in designing a vaccine efficacy trial during a public health emergency. In contrast to existing literature on trial design, InterVax-Tool offers high-level visual and interactive assistance through a set of four decision trees, guiding users through selection of 1) the Primary Endpoint, (2) the Target Population, (3) Randomization, and (4) the Comparator. Guidance is provided on how each of fourteen key considerations–grouped as Epidemiological, Vaccine-related, Infrastructural, or Sociocultural–should be used to inform each decision in the trial design process. The tool is not intended to provide a black box decision framework for identifying an optimal trial design, but rather to facilitate transparent, collaborative and comprehensive discussion of the relevant decisions, while recording the decision process. The tool can also assist capacity building by providing a cross-disciplinary picture of trial design using concepts from epidemiology, study design, vaccinology, biostatistics, mathematical modeling and clinical research ethics. Here, we describe the goals and features of InterVax-Tool as well as its application to the design of a Zika vaccine efficacy trial. One Sentence Summary An interactive web-based decision support tool was developed to assist in the design of vaccine efficacy trials during emerging outbreaks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,049
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,123
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,951
Score d'incertitude au seuil0,258

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0490,123
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0050,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0080,005
Science ouverte0,0040,007
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0440,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineMéthodes
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetViral Infections and Outbreaks ResearchTravaux en français237 207