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Enregistrement W2789656041 · doi:10.1093/jcag/gwy008.296

A295 FUCOSE AVAILABILITY AND ITS UTILIZATION IMPACT IN VIVOENTERIC PATHOGEN VIRULENCE.

2018· article· en· W2789656041 sur OpenAlexaff
Joannie M. Allaire, Kirandeep Bhullar, Shauna M. Crowley, Martin Ståhl, Hong Yang, Elena F. Verdú, Hongbing Yu, Bruce A. Vallance

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensMcMaster UniversityBC Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCitrobacter rodentiumFucoseMicrobiologyVirulencePathogenBiologyIn vivoSecretionBiochemistryGalactoseGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Attaching and effacing (A/E) pathogens such as Enterohemorrhagic E. coli (EHEC) are important causes of diarrheal disease worldwide. Interestingly, little is known about how these bacteria obtain key nutrients, and whether these nutrients modulate pathogen colonization and gut infection. For example, fucose is an important sugar and bacterial food source cleaved from host glycans found on the intestinal mucosal surface via the actions of commensal microbes expressing fucosidase enzymes. Interestingly, although the mouse A/E pathogen Citrobacter rodentium does not itself express a fucosidase, recent studies have found that it and EHEC use a fucose sensing system to modulate their pathogenicity in vitro. At present, it is unclear what role fucose metabolism may play in A/E pathogen virulence and metabolism in vivo. To address this, we focused on C. rodentium enzyme L-fuculose kinase (encoded by the fucK gene), which plays a key role in the L-fucose metabolic pathway and fucose utilization as a food source. We investigated the roles of fucose and the enzyme L-fuculose kinase in controlling C. rodentium pathogenesis. Wildtype (WT) and ΔfucK C. rodentium were used for in vitro assays (type three secretion, growth and adhesion assays) and for in vivo infection. C57Bl/6 mice were infected either separately, or with both C. rodentium strains at a dose of 10^8 colony forming units. In some infections, mice were pretreated with streptomycin (20mg 24h pre-infection) or were fed fucose (200ul of 25mM L-fucose 2x/day). Bacterial burdens, pathology score and competitive assay were assessed on day 6 post-infection. In vitro virulence assays identified no significant differences between ΔfucK and WT C. rodentium regarding type three secretion, growth or adherence to cultured epithelial cells. Moreover, both WT and ΔfucK C. rodentium readily colonized the intestines of mice either pretreated (or not), with streptomycin, with pathogen burdens, localisation and histological pathology scores similar between the two strains. In contrast, simultaneous infection by both strains (competitive assay) within the same mice revealed the ΔfucK strain was significantly impaired when competing with WT C. rodentium (no streptomycin). In contrast, ΔfucK was able to equally compete with WT C. rodentium when streptomycin pretreatment was given to deplete commensal bacteria. Feeding fucose to these streptomycin treated mice again reduced the ability of the ΔfucK strain to compete with WT C. rodentium. These results indicate that the fucK-dependent fucose metabolic pathway promotes but is not essential to C. rodentium pathogenesis. Moreover these findings suggest that commensal microbes play a key role in controlling fucose availability in the gut, and thereby impact A/E pathogen metabolism and virulence. CCC, CIHRNSERC, FRQS

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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