Quantitative Ex Vivo MRI Changes due to Progressive Formalin Fixation in Whole Human Brain Specimens: Longitudinal Characterization of Diffusion, Relaxometry, and Myelin Water Fraction Measurements at 3T
Notice bibliographique
Résumé
Purpose: Postmortem MRI can be used to reveal important pathologies and establish radiology-pathology correlations. However, quantitative MRI values are altered by tissue fixation. Therefore, the purpose of this study was to investigate time-dependent effects of formalin fixation on MRI relaxometry (T1 and T2), diffusion tensor imaging (fractional anisotropy, FA; and mean diffusivity, MD), and myelin water fraction (MWF) measurements throughout intact human brain specimens. Methods: Two whole, neurologically-healthy human brains were immersed in 10% formalin solution and scanned at 13 time-points between 0 and 1032 hours. Whole brain maps of longitudinal (T1) and transverse (T2) relaxation times, FA, MD, and MWF were generated at each time-point to illustrate spatiotemporal changes, and region-of-interest analyses were then performed in eight brain structures to quantify temporal changes with progressive fixation. Results: Although neither of the diffusion measures (FA nor MD) showed significant changes as a function of formalin fixation time, both T1 and T2-relaxation times significantly decreased, and MWF estimates significantly increased with progressive fixation until (and likely beyond) our final measurements were taken at 1032 hours. Conclusions: These results suggest that T1-relaxation, T2-relaxation and MWF estimates must be performed quite early in the fixation process to avoid formalin-induced changes compared to in vivo values; and furthermore, that different ex vivo scans within an experiment must be acquired at consistent (albeit still early) fixation intervals to avoid fixative-related differences between samples. Conversely, ex vivo diffusion measures (FA and MD) appear to depend more on other factors (e.g., pulse sequence optimization, sample temperature, etc.).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».