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Enregistrement W2790168389 · doi:10.14288/1.0364285

Exploring novel human pancreatic alpha-amylase inhibitors : a departure from carbohydrate-based therapeutics

2019· article· en· W2790168389 sur OpenAlexaff
Christina Tysoe

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatitis Pathology and Treatment
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlpha-amylaseAlpha (finance)AmylaseComputational biologyChemistryMedicineBiochemistryBiologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human pancreatic α-amylase (HPA) catalyzes a key step in the degradation of ingested starch. Accordingly HPA activity has been positively correlated to post-prandial blood glucose levels and has been identified as a viable target for inhibition and the development of therapeutics towards the treatment of diabetes and obesity. This work directs the hunt away from traditional saccharide-based inhibitors, which represent all carbohydrate metabolism therapeutics currently in use, to novel inhibitors with improved selectivity and potency. In Chapter 2, the synthesis of flavonol-based HPA inhibitors based upon the structure of Montbretin A, a complex flavonol glycoside, is explored. Through the synthesis of a library of Montbretin A analogues we were able to identify an inhibitor of HPA with a KI of 44 nM that formed new interactions within the amylase active site. Chapter 3 details work on the peptide-based HPA inhibitor helianthamide previously isolated from the Caribbean Sea anemone Stichodactyla helianthus. Recombinant expression of helianthamide as a fusion peptide was achieved in Escherichia coli and Pichia pastoris. Kinetic analysis indicated that recombinant helianthamide is one of the most potent HPA inhibitors known to date, with a KI of 0.01 nM. Structural analysis of the recombinant material indicated that it contained three disulfide bonds in a 1-5, 2-4, 3-6 pattern. Site-directed mutagenesis of helianthamide indicated that disruption of disulfide bonds led to a large decrease in potency, while alanine variants of residues forming polar contacts with HPA’s active site residues led to smaller decreases in potency, indicating that the intact tertiary structure of helianthamide is necessary for blockage of the amylase active site. Small peptides were synthesized based on the sequence of helianthamide, but most showed modest or no inhibition of HPA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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