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Enregistrement W2790311764 · doi:10.1002/ajmg.a.38628

A novel homozygous <i>AP4B1</i> mutation in two brothers with AP‐4 deficiency syndrome and ocular anomalies

2018· article· en· W2790311764 sur OpenAlexaff
Andrea Accogli, Fadi F. Hamdan, Chantal Poulin, Christina Nassif, Guy A. Rouleau, Jacques L. Michaud, Myriam Srour

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueHereditary Neurological Disorders
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Neurological Institute and HospitalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrocephalyExome sequencingMutationGeneticsSanger sequencingPhenotypeVentriculomegalyCompound heterozygosityBiologyMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adaptor protein complex-4 (AP-4) is a heterotetrameric protein complex which plays a key role in vesicle trafficking in neurons. Mutations in genes affecting different subunits of AP-4, including AP4B1, AP4E1, AP4S1, and AP4M1, have been recently associated with an autosomal recessive phenotype, consisting of spastic tetraplegia, and intellectual disability (ID). The overlapping clinical picture among individuals carrying mutations in any of these genes has prompted the terms "AP-4 deficiency syndrome" for this clinically recognizable phenotype. Using whole-exome sequencing, we identified a novel homozygous mutation (c.991C>T, p.Q331*, NM_006594.4) in AP4B1 in two siblings from a consanguineous Pakistani couple, who presented with severe ID, progressive spastic tetraplegia, epilepsy, and microcephaly. Sanger sequencing confirmed the mutation was homozygous in the siblings and heterozygous in the parents. Similar to previously reported individuals with AP4B1 mutations, brain MRI revealed ventriculomegaly and white matter loss. Interestingly, in addition to the typical facial gestalt reported in other AP-4 deficiency cases, the older brother presented with congenital left Horner syndrome, bilateral optic nerve atrophy and cataract, which have not been previously reported in this condition. In summary, we report a novel AP4B1 homozygous mutation in two siblings and review the phenotype of AP-4 deficiency, speculating on a possible role of AP-4 complex in eye development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,509
Score d'incertitude au seuil0,819

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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