Genetic Variations, Exposure to Persistent Organic Pollutants and Breast Cancer Risk – A Greenlandic Case–Control Study
Notice bibliographique
Résumé
This study investigated the effects of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in xenobiotic and steroid hormone-metabolizing genes in relation to breast cancer risk and explored possible effect modifications on persistent organic pollutants (POPs) and breast cancer associations. The study also assessed effects of Greenlandic BRCA1 founder mutations. Greenlandic Inuit women (77 cases and 84 controls) were included. We determined two founder mutations in BRCA1: Cys39Gly (rs80357164) and 4684delCC, and five SNPs in xenobiotic and oestrogen-metabolizing genes: CYP17A1 -34T>C (rs743572), CYP19A1 *19C>T (rs10046), CYP1A1 Ile462Val (rs1048943), CYP1B Leu432Val (rs1056836) and COMT Val158Met (rs4680). We used chi-square test for comparison of categorical variables between groups. Odds ratio (OR) estimates with 95% confidence interval (95%CI) were obtained using logistic regression models. The variant allele of BRCA1 Cys39Gly increased breast cancer risk (Gly/Cys versus Cys/Cys, OR: 12.2, 95%CI: 1.53; 98.1), and carriers of the variant allele of CYP17A1 -34T>C had reduced risk (CT+CC versus TT, OR: 0.44, 95%CI: 0.21; 0.93). CYP17A1 -34T>C was an effect modifier on the association between perfluoroalkyl acids (PFAAs) and breast cancer risk (∑PFAA, ratio of OR: 0.18, 95%CI: 0.03; 0.97). Non-significant modifying tendencies were seen for the other SNPs on the effect of polychlorinated biphenyls, organochlorine pesticides and PFAAs. In summary, the BRCA1 Cys39Gly and CYP17A1 -34T>C genetic variations were associated with breast cancer risk. Our results indicate that the evaluated genetic variants modify the effects of POP exposure on breast cancer risk; however, further studies are needed to document the data from the relatively small sample size.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».