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Enregistrement W2790423420 · doi:10.1002/humu.23409

MeCP2 AT-Hook1 mutations in patients with intellectual disability and/or schizophrenia disrupt DNA binding and chromatin compaction in vitro

2018· article· en· W2790423420 sur OpenAlexafffund
Taimoor I. Sheikh, Ricardo Harripaul, Muhammad Ayub, John B. Vincent

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensQueen's UniversityUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesOntario Rett Syndrome AssociationUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health Foundation
Mots-clésMECP2Rett syndromeMissense mutationBiologyGeneticsExome sequencingMutationGenePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in the methyl-CpG-binding protein-2 gene (MECP2) are commonly associated with Rett syndrome. However, it has long been appreciated that there exists a spectrum of neuropsychiatric phenotypes associated with MECP2 variants. The most frequent Rett missense mutations are located in either the methyl-CpG-binding domain (MBD) or transcription repression domain (TRD). Clinical roles for mutations in other domains such as the intervening domain (ID) or AT-Hook domains have yet to be determined. Here, we report functional analysis of MECP2 missense mutations, located in AT-Hook1 within the ID, in a large Pakistani family with childhood onset cognitive decline and schizophrenia (SCZ), de novo in a girl with atypical Rett syndrome, and de novo in a woman with SCZ. We show that both p.Arg190His and p.Arg190Cys affect the ability of MeCP2 to bind to AT-rich DNA, also the brain-derived neurotrophic factor (BDNF) promoter, with the more drastic effects seen for p.Arg190Cys. Both mutations also affect nuclear chromatin clustering in vitro. These data support a possible molecular link between MECP2 AT-Hook1 mutations and psychosis. Given the ongoing large-scale whole exome and whole genome sequencing projects for psychiatric disorders, our findings suggest that rare missense variants in MECP2 be carefully evaluated for molecular consequences.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,697
Score d'incertitude au seuil0,364

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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