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Enregistrement W2790445358 · doi:10.1017/s0022029917000851

Characterisation of<i>Staphylococcus aureus</i>strains isolated from mastitis bovine milk in Argentina

2018· article· en· W2790445358 sur OpenAlex
Mariela E. Srednik, Valentine Usongo, Sarah Lépine, Xavier Janvier, Marie Archambault, E. Gentilini

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Dairy Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensUniversité de MontréalCegep de Saint Hyacinthe
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClindamycinPenicillinMicrobiologyErythromycinStaphylococcus aureusBiologyMastitisPulsed-field gel electrophoresisAntibioticsVeterinary medicineSCCmecCloxacillinMultilocus sequence typingRaw milkGenotypeBacteriaMedicineMethicillin-resistant Staphylococcus aureusFood scienceGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The study reported in this Research Communication was conducted to characterise Staphylococcus aureus isolates recovered from mastitic bovine milk from dairy herds in Argentina. A total of 829 mastitic milk samples, both clinical and subclinical, were collected from 21 farms by veterinarians and submitted to the laboratory for testing from which 229 S. aureus isolates were recovered, an isolation rate of 28·1%. These isolates were tested for susceptibility to the antibiotics penicillin, erythromycin and clindamycin. Of the 229 isolates, 53 (23·1%) were resistant to penicillin, 31 (13·5%) to erythromycin and 28 (12·2%) to clindamycin. All isolates were negative for the mec A, mec C and pvl genes by PCR. Southernblot hybridisation revealed that the erm C gene was located on plasmid bands. Eighty isolates were randomly selected from the 229 for further characterisation. Restriction analysis of chromosomal DNA with Cf9I followed by PFGE of the 80 isolates revealed 23 distinct pulsotypes at 80% similarity. Seven major types (A, B, N, P, S, T, U and V) accounted for 68·7% of these isolates and 12 pulsotypes (A, B, F, G, J, K, M, N, P, S, T and U) occurred on more than one farm indicating genetic diversity within the farms. MLST of a representative isolate from dominant types identified the STs 97 705, 746, 2102 and 2187 with ST97 being the most predominant. Antibiotic susceptibility testing showed that 53·7% of the 80 randomly selected isolates were resistant to at least one of the three antibiotics tested. To our knowledge, this study represents the first large scale molecular studies on S. aureus isolates from dairy farms in Argentina.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,768
Score d'incertitude au seuil0,968

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,360
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle