Molecular analysis of human- and pig-derived<i>Ascaris</i>in Honduras
Notice bibliographique
Résumé
Ascaris sp. is a soil-transmitted helminth (STH) significantly affecting the health of human and swine populations. Health inequities and poverty, with resulting deficiencies in water, sanitation and hygiene, are directly associated with Ascaris lumbricoides prevalence in humans. Resource constraints also lead to small-scale livestock production under unsanitary conditions. Free-ranging pigs, for instance, are exposed to a number of infectious agents, among which Ascaris suum is one of the most common. Under these conditions, close proximity between people and pigs can result in cross-contamination; that is, pigs harbouring human Ascaris and vice versa. Moreover, the potential interbreeding between these two Ascaris species has been demonstrated. The present study analysed Ascaris worms obtained from children and pigs in Honduras. Adult worms were collected from stool samples of children after pharmacological treatment, and from pigs' intestines after slaughter for commercial purposes at a local abattoir. A nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region was amplified by polymerase chain reaction (PCR) and digested with a restriction enzyme in order to separate putative human- and pig-derived Ascaris isolates. PCR products were also sequenced, and cladograms were constructed. All parasites isolated from children showed the typical human-derived genotype of Ascaris, whereas 91% of parasites from pigs showed the expected pig-derived genotype. Cross-infections between hosts were not demonstrated in this study. Nine per cent of pig-derived worms showed a restriction band pattern highly suggestive of a hybrid human-pig Ascaris genotype. These results contribute to the understanding of ascariasis epidemiology and its zoonotic potential in a highly endemic region.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».