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Enregistrement W2790479378 · doi:10.1111/apm.12812

Histopathological evaluation of duodenal biopsy in the PreventCD project. An observational interobserver agreement study

2018· article· en· W2790479378 sur OpenAlexfundno aff
Vincenzo Villanacci, Luisa Lorenzi, Francesco Donato, Renata Auricchio, Piotr Dziechciarz, Judit Gyimesi, Sibylle Koletzko, Zrinjka Mišak, Vanesa Morente Laguna, Isabel Polanco, David Ramos, Raanan Shamir, Riccardo Troncone, Sabine L. Vriezinga, M. Luisa Mearin

Notice bibliographique

RevueApmis · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCeliac Disease Research and Management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIIKomitet Badań NaukowychAzrieli FoundationHungarian Scientific Research FundEurospitalEuropean CommissionThermo Fisher Scientific
Mots-clésObservational studyMedicineBiopsyRadiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aim of the current study was to evaluate the inter-observer agreement between pathologists in the diagnosis of celiac disease (CD), in the qualified context of a multicenter study. Biopsies from the "PreventCD" study, a multinational- prospective- randomized study in children with at least one-first-degree relative with CD and positive for HLA-DQ2/HLA-DQ8. Ninety-eight biopsies were evaluated. Considering diagnostic samples with villous atrophy (VA), the agreement was satisfactory (κ = 0.84), but much less when assessing the severity of these lesions. The use of the recently proposed Corazza-Villanacci classification showed a moderately higher level of agreement (κ = 0.39) than using the Marsh-Oberhuber system (κ = 0.31). 57.1% of cases were considered correctly oriented. A number of >4 samples per patient was statistically associated to a better agreement; orientation did not impact on κ values. Agreement results in this study appear more satisfactory than in previous papers and this is justified by the involvement of centers with experience in CD diagnosis and by the well-controlled setting. Despite this, the reproducibility was far from optimal with a poor agreement in grading the severity of VA. Our results stress the need of a minimum of four samples to be assessed by the pathologist.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,018
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,990
Score d'incertitude au seuil0,053

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,018
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,402
Tête enseignante GPT0,483
Écart entre enseignants0,081 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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