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Enregistrement W2790499767 · doi:10.1021/acs.jpcb.8b00714

Cryospectroscopy Studies of Intact Light-Harvesting Antennas Reveal Empirical Electronic Energy Transitions in Two Cyanobacteria Species

2018· article· en· W2790499767 sur OpenAlexaff
Collins Nganou, Noam Adir, Martin Mkandawire

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensCape Breton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhycobilisomeTrimerAllophycocyaninChromophorePhotoexcitationFluorescenceCoupling (piping)ExcitonSpectroscopyChemistryPhotochemistryMolecular physicsMaterials sciencePhycocyaninOptoelectronicsDimerAtomic physicsPhysicsOpticsCyanobacteriaExcited stateBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding of electronic energy transition (EET) mechanisms from the light-harvesting unit to the reaction center in a natural system has been limited by (a) the use of conventional transient time-resolved spectroscopy at room temperature, which result in high signal-to-noise ratio and (b) examining extracts instead of intact light-harvesting units. Here, we report previously unknown differences and new insight in EET of two cyanobacteria species, Acaryochloris marina and Thermosynechoccocus vulcanus, which have been found only after using UV–vis, hole-burning, and fluorescence spectroscopy at ultralow temperature and examining their intact light-harvesting unit, phycobilisomes (PBS). Although the exciton formation is similarly induced by photoexcitation of chromophore assemblies in phycocyanin (PC) and allophycocyanin (APC) in PBSs of both species, the EET mechanisms are totally different, being adiabatic in A. marina and nonadiabatic in T. vulcanus . The PBS of A. marina has only one APC trimer and energy transfer is through coupling of α 84 in APC with β 84 in adjacent PC. In T. vulcanus, the PBS has three components: coupling between APC core and the entire PC rod and couplings of β–β 18 and of L CM to β in the adjacent APC-like trimer. A total of 80% of the excitation energy is trapped in the coupling β–β 18 and regulates the flow of energy from the high- to low-level terminal electronic transition emitter β-L CM . All these details cannot be observed at room temperature and in extracted units.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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