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Enregistrement W2790539376 · doi:10.3389/fphar.2018.00034

HDAC6 Inhibition Promotes Transcription Factor EB Activation and Is Protective in Experimental Kidney Disease

2018· article· en· W2790539376 sur OpenAlexafffund
Angela S. Brijmohan, Sri Nagarjun Batchu, Syamantak Majumder, Tamadher A. Alghamdi, Karina Thieme, Sarah McGaugh, Youan Liu, Suzanne L. Advani, Bridgit B. Bowskill, M. Golam Kabir, Laurette Geldenhuys, Ferhan Siddiqi, Andrew Advani

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Pharmacology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHistone Deacetylase Inhibitors Research
Établissements canadiensDalhousie UniversitySt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesBanting and Best Diabetes Centre, University of TorontoNovo NordiskKidney Foundation of CanadaCanadian Society of NephrologyHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésTranscription factorHDAC6Cell biologyChemistryCancer researchPharmacologyMedicineBiologyBiochemistryDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To contend with the deleterious effects of accumulating misfolded protein aggregates or damaged organelles cells rely on a system of quality control processes, among them the autophagy-lysosome pathway. This pathway is itself controlled by a master regulator transcription factor termed transcription factor EB (TFEB). When TFEB localizes to the cell nucleus it promotes the expression of a number of genes involved in protein clearance. Here, we set out to determine (1) whether TFEB expression is altered in chronic kidney disease (CKD); (2) whether inhibition of the cytosolic deacetylase histone deacetylase 6 (HDAC6) affects TFEB acetylation and nuclear localization; and (3) whether HDAC6 inhibition, in turn, alters the natural history of experimental CKD. TFEB mRNA and protein levels were observed to be diminished in the kidneys of humans with diabetic kidney disease, accompanied by accumulation of the protein aggregate adaptor protein p62 in tubule epithelial cells. In cultured NRK-52E cells, HDAC6 inhibition with the small molecule inhibitor Tubastatin A acetylated TFEB, increasing TFEB localization to the nucleus and attenuating cell death. In a rat model of CKD, Tubastatin A prevented the accumulation of misfolded protein aggregates in tubule epithelial cells, attenuated proteinuria progression, limited tubule cell death and diminished tubulointerstitial collagenous matrix deposition. These findings point to the common occurrence of dysregulated quality control processes in CKD and they suggest that TFEB downregulation may contribute to tubule injury in CKD. They also identify a regulatory relationship between HDAC6 and TFEB. HDAC6 inhibitors and TFEB activators both warrant further investigation as treatments for CKD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,627

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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