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Enregistrement W2790600486 · doi:10.4490/algae.2018.33.3.4

Morphological and genetic characterization and the nationwide distribution of the phototrophic dinoflagellate Scrippsiella lachrymosa in the Korean waters

2018· article· en· W2790600486 sur OpenAlexaboutno aff
Sung Yeon Lee, Hae Jin Jeong, Ji Hyun You, So Jin Kim

Notice bibliographique

RevueALGAE · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Science and ICT, South KoreaNational Research Foundation of KoreaMinistry of Oceans and FisheriesKorea Institute of Marine Science and Technology promotionMinistry of Science, ICT and Future PlanningNational Research Foundation
Mots-clésInternal transcribed spacerDinoflagellateBiologyStrain (injury)Ribosomal DNABotanyRibosomal RNAPhylogenetic treeGeneticsGeneAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The phototrophic dinoflagellate genus Scrippsiella is known to have a worldwide distribution.Here, we report for the first time, the occurrence of Scrippsiella lachrymosa in Korean waters.Unlike the other stains of S. lachrymosa whose cultures had been established from cysts in the sediments, the clonal culture of the Korean strain of S. lachrymosa was established from motile cells.When the sulcal plates of S. lachrymosa, which have not been fully described to date, were carefully examined using scanning electron microscopy, the Korean strain of S. lachrymosa clearly exhibited the anterior sulcal plate (s.a.), right sulcal plate (s.d.), left sulcal plate (s.s.), median sulcal plate (s.m.), and posterior sulcal plate (s.p.).When properly aligned, the large subunit (LSU) rDNA sequence of the Korean strain of S. lachrymosa was ca.1% different from those of two Norwegian strains of S. lachrymosa, the only strains for which LSU sequences have been reported.The internal transcribed spacer (ITS) rDNA sequence of the Korean strain of S. lachrymosa was also ca.1% different from those of the Scottish and Chinese strains and 3% different from those of the Canadian, German, Greek, and Portuguese strains.Thus, the Korean S. lachrymosa strain has unique LSU and ITS sequences.The abundances of S. lachrymosa in the waters of 28 stations, located in the East, West, and South Sea of Korea, were quantified in four seasons from January 2016 to October 2017, using quantitative real-time polymerase chain reaction method and newly designed specific primer-probe sets.Its abundances were >0.1 cells mL -1 at eight stations in January and March 2016 and March 2017, and its highest abundance in Korean waters was 26 cells mL -1 .Thus, S. lachrymosa has a nationwide distribution in Korean waters as motile cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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