Proteomic analysis of chemosensory organs in the honey bee parasite <i>Varroa destructor</i> : a comprehensive examination of the potential carriers for semiochemicals
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The mite Varroa destructor is the major parasite of the honey bee and is responsible for great economical losses. The biochemical tools used by Varroa to detect semiochemicals produced by the host are still largely unknown. We have performed proteomic analysis on chemosensory organs of this species in order to identify putative soluble carriers for pheromones and other olfactory cues emitted by the host. In particular, we have analysed forelegs, mouthparts (palps, chelicera and hypostome) and the second pair of legs (as control tissue) in reproductive and phoretic stages of the Varroa life cycle. We identified 958 Varroa proteins, most of them common to organs and stages. Sequence analysis shows that four proteins can be assigned to the odorant-binding protein (OBP)-like class, which bear some similarity to insect OBPs, but so far are only reported in some Chelicerata. In addition, we have detected the presence of two proteins belonging to the Niemann-Pick family, type C2 (NPC2), which have been suggested to act as semiochemical carriers. This work contributes to elucidating the chemical communication systems in Varroa with the aim of understanding how detection of semiochemicals has evolved in terrestrial non-hexapod Arthropoda. Data are available via ProteomeXchange with identifier PXD008679.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».