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Enregistrement W2790735892 · doi:10.1136/bmj.k400

Data sharing and reanalysis of randomized controlled trials in leading biomedical journals with a full data sharing policy: survey of studies published in<i>The BMJ</i>and<i>PLOS Medicine</i>

2018· review· en· W2790735892 sur OpenAlexaff
Florian Naudet, Charlotte Sakarovitch, Perrine Janiaud, Ioana A. Cristea, Daniele Fanelli, David Moher, John P. A. Ioannidis

Notice bibliographique

RevueBMJ · 2018
Typereview
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReceiptData sharingRandomized controlled trialMedicineMEDLINEConfidence intervalAlternative medicineFamily medicineComputer scienceWorld Wide WebSurgeryInternal medicinePolitical sciencePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: To explore the effectiveness of data sharing by randomized controlled trials (RCTs) in journals with a full data sharing policy and to describe potential difficulties encountered in the process of performing reanalyses of the primary outcomes. DESIGN: Survey of published RCTs. SETTING: PubMed/Medline. ELIGIBILITY CRITERIA: subsequent to the adoption of data sharing policies by these journals. MAIN OUTCOME MEASURE: The primary outcome was data availability, defined as the eventual receipt of complete data with clear labelling. Primary outcomes were reanalyzed to assess to what extent studies were reproduced. Difficulties encountered were described. RESULTS: ) published between 2013 and 2016 met the eligibility criteria. 17/37 (46%, 95% confidence interval 30% to 62%) satisfied the definition of data availability and 14 of the 17 (82%, 59% to 94%) were fully reproduced on all their primary outcomes. Of the remaining RCTs, errors were identified in two but reached similar conclusions and one paper did not provide enough information in the Methods section to reproduce the analyses. Difficulties identified included problems in contacting corresponding authors and lack of resources on their behalf in preparing the datasets. In addition, there was a range of different data sharing practices across study groups. CONCLUSIONS: Data availability was not optimal in two journals with a strong policy for data sharing. When investigators shared data, most reanalyses largely reproduced the original results. Data sharing practices need to become more widespread and streamlined to allow meaningful reanalyses and reuse of data. TRIAL REGISTRATION: Open Science Framework osf.io/c4zke.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,672
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,878
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Reproductibilité · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,328
Score d'incertitude au seuil0,404

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,6720,878
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,005
Bibliométrie0,0250,040
Études des sciences et des technologies0,0040,007
Communication savante0,0140,018
Science ouverte0,0050,012
Intégrité de la recherche0,0050,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,926
Tête enseignante GPT0,654
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineReproductibilité
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations213
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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