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Enregistrement W2790876483 · doi:10.1093/jcag/gwy009.129

A129 THE ROLE OF BACTERIAL HTPG IN HOST-MICROBIOME INTERACTIONS IN CROHN’S DISEASE

2018· article· en· W2790876483 sur OpenAlexaff
Emma Finlayson‐Trick, Jessica Connors, Scott Whitehouse, Andrew W. Stadnyk, Johan Van Limbergen

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacological Effects of Natural Compounds
Établissements canadiensIzaak Walton Killam Health CentreDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBacteroides fragilisBiologyHeat shock proteinImmune systemCytokineImmunologyBacteroidesChaperone (clinical)Interleukin 8MicrobiomeMicrobiologyBacteriaMedicineBioinformaticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The bacterial chaperone high temperature protein G (HtpG), a homolog of eukaryotic heat shock protein 90 (Hsp90), functions to protect bacteria by stabilizing proteins against a variety of environmental stresses. We recently observed increased abundance of HtpG amongst several metagenomic pathways associated with sustained remission in pediatric Crohn’s disease patients treated with exclusive enteral nutrition (Dunn et al., 2016). HtpG and other chaperones from several bacteria have been reported to induce the production of CXCL8 in human fibroblasts, endothelial cells, and monocytes (Shelburne et al., 2007). Bacterial heat shock proteins (e.g. Hsp65) have been reported to protect against colitis in mice (Gomes-Santos et al., 2017). Understanding the impact of bacterial HtpG on intestinal immune responses will provide important mechanistic insight into how HtpG may promote sustained remission following exclusive enteral nutrition. To establish the degree of impact that HtpG has on innate immune functions of intestinal epithelial cells. HT-29 cells (a human colon adenocarcinoma cell line) were treated with Bacteroides fragilis recombinant (r) HtpG (2 μg/ml or 10 μg/ml), or media alone for 24 hours. CXCL8 cytokine expression was measured from HT-29 supernatants using an ELISA assay. Preliminary data indicate that lower concentrations of rHtpG result in increased CXCL8 cytokine expression in HT-29 cells. In comparison to the media control, CXCL8 expression in cells treated with 2 μg/ml rHtpG was markedly increased and greater than cells treated with 10 μg/ml rHtpG. We found that lower concentrations of bacterial HtpG, as observed in pediatric Crohn’s disease patients unable to sustain remission, resulted in increased expression of CXCL8 in intestinal epithelial cells. These findings may be of particular relevance to the subset of Crohn’s disease patients who have an innate immune dysfunction associated with lower neutrophil chemotaxis (Marks et al., 2006). CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,276
Score d'incertitude au seuil0,735

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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