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Enregistrement W2790946827 · doi:10.1101/gad.311639.118

Structural and functional analysis of the DOT1L–AF10 complex reveals mechanistic insights into MLL-AF10-associated leukemogenesis

2018· article· en· W2790946827 sur OpenAlexafffund
Heng Zhang, Bo Zhou, Qin Su, Jing Xu, Rachel Harding, W. Tempel, Vinod Nayak, Yanjun Li, P. Loppnau, Yali Dou, Jinrong Min

Notice bibliographique

RevueGenes & Development · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesEshelman Institute for Innovation, University of North Carolina at Chapel HillBiological and Environmental ResearchJanssen BiotechMerck Sharp and DohmeNational Research Council CanadaCanadian Institutes of Health ResearchInnovative Medicines InitiativeEuropean CommissionAbbVieNovartis PharmaCanada Foundation for InnovationArgonne National LaboratoryOntario Genomics InstituteWestern Economic Diversification CanadaUniversity of SaskatchewanOntario Institute for Cancer ResearchWellcome TrustOntario GenomicsCanadian Light SourceFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloGenome CanadaMerck KGaAEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsPfizerNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaBoehringer IngelheimU.S. Department of Energy
Mots-clésBiologyHomeoboxComputational biologyLeucine zipperGeneticsCell biologyZinc fingerCancer researchGeneTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mixed-lineage leukemia (MLL)-AF10 fusion oncoprotein recruits DOT1L to the homeobox A ( HOXA ) gene cluster through its octapeptide motif leucine zipper (OM-LZ), thereby inducing and maintaining the MLL-AF10-associated leukemogenesis. However, the recognition mechanism between DOT1L and MLL-AF10 is unclear. Here, we present the crystal structures of both apo AF10 OM-LZ and its complex with the coiled-coil domain of DOT1L. Disruption of the DOT1L–AF10 interface abrogates MLL-AF10-associated leukemic transformation. We further show that zinc stabilizes the DOT1L–AF10 complex and may be involved in the regulation of the HOXA gene expression. Our studies may also pave the way for the rational design of therapeutic drugs against MLL -rearranged leukemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,219
Score d'incertitude au seuil0,603

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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