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Enregistrement W2791202675 · doi:10.1093/jcag/gwy009.020

A20 GUT MICROBIOTA-DIET INTERACTION ALTER INTESTINAL MAST CELL NUMBERS AND DISTRIBUTION IN THE HUMANIZED IBS MOUSE MODEL

2018· article· en· W2791202675 sur OpenAlexaff
Chiko Shimbori, Giada De Palma, David E. Reed, Marc Pigrau, Jun Lü, Y Zhang, Yang Yu, Nestor N. Jiménez-Vargas, Jessica Sessenwein, Cintya D. Lopez Lopez, Josue O. Jaramillo Polanco, Elena F. Verdú, Stephen M. Collins, Alan Lomax, Michael Beyak, S Vanner, Přemysl Berčík

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGastrointestinal motility and disorders
Établissements canadiensQueen's UniversityKingston General HospitalMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGut floraBiologyImmune systemIntestinal permeabilityMast cellTryptaseIleumHistamineInternal medicineImmunologyEndocrinologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Growing evidence suggests that immune activation and gut microbiota are involved in the pathophysiology of IBS. We have recently demonstrated that a diet low in fermentable oligosaccharides, disaccharides, monosaccharides and polyols (FODMAP) improved symptoms in IBS patients and this was associated with lower urinary histamine and changes in the microbiota composition. A high FODMAP diet in germ-free mice colonized with IBS patient microbiome modulated motility, permeability, and visceral sensitivity. However, the underlying mechanisms are unclear. To investigate the interactions of host’s immune system and intestinal microbiota in response to FODMAPs in the humanized IBS mouse model. Germ-free NIH Swiss mice were colonized with fecal microbiota from two IBS patients (non-constipation) with a high (HH) or low (LH) urinary histamine (n=24 mice/patient), and one healthy control (HV) (n=8). SPF mice (n=8) were included as additional controls. Mice were assigned to a custom-made low or high FODMAP diet (LF and HF, respectively). Microbiota composition was analysed by 16S rRNA gene sequencing. At sacrifice, intestinal tissues were collected for immunohistochemistry (c-kit staining) and immunofluorescence (tryptase, PGP9.5, and Substance P) detection of mast cell and nerves. HH colonized mice receiving HF diet had increased number of mast cells (c-kit positive cells) in both small intestine and colon compared to HH mice on a LF diet (Effect of diet x microbiota: p=0.041, F(1,32)=4.51 for small intestine, and p=0.029, F(1,30)=5.25 for colon). No differences were observed in the colon and small intestine of LH colonized mice. Immunofluorescent staining of colonic and small intestinal sections revealed high number of tryptase positive mast cells in HH colonized mice on HF diet. Moreover, the majority of the mast cells were in close proximity of nerve fibers (PGP9.5 positive) (Fig 1). In HH colonized mice, colonic mast cell numbers were negatively correlated with the relative abundance of Adlercreutzia spp, Oscillospira and Ruminococcus spp. Similarly, in the small intestine of HH colonized mice, mast cell numbers negatively correlated with the relative abundance of Blautia, Ruminococcus, and Lactobacillus spp. A high fermentable diet alters intestinal microbiota composition only in mice colonized with microbiota from a patient with high urinary histamine. These changes are associated with increased numbers of mast cells in both the colon and small intestine. Furthermore, mast cells seem to closely interact with neurons, likely contributing to the functional changes observed in these mice. CIHRNIH

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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