Multiplexed in vivo photoacoustic imaging of photoswitchable chromoproteins GAF2 and BphP1 with difference spectra differentiation (Conference Presentation)
Notice bibliographique
Résumé
Photoswitchable chromoproteins allow for molecular photoacoustic images with reduced hemoglobin background signal. We have previously introduced GAF2 a far-red photoswitchable chromoprotein similar to BphP1 [Yao et al., Nat. Meth. 13, 67–73 (2016)], but one-tenth the size. We introduce a new strategy for differentiating between spectrally similar photoswitchable chromoproteins. This strategy is based on exploiting relative spectral differences between two photoswitchable absorption states. We present in vivo photoacoustic images of GAF2 and BphP1 with differentiation based on their relative intensity change. We imaged using a custom photoswitchable photoacoustic imaging system that allows simultaneous background-free photoacoustic signal acquisition and difference spectra differentiation. E.coli expressing BphP1 and GAF2 are injected at various depths in hairless SCID mice. Background-free photoacoustic images are obtained and the chromoproteins are differentiated based on their relative intensity change. We photoconvert GAF2 and BphP1 using 607.5nm (5.2mJ/cm2) and 710nm (8.3mJ/cm2) light. The cycle of imaging and photoconversion is 20s. We are able to obtain background-free photoacoustic images 1.2cm deep in vivo and clearly differentiate between GAF2 and BphP1 via relative intensity changes despite similar imaging spectra. Photoswtichable chromoproteins and difference spectra differentiation could prove promising for deep multiplexed molecular background-free photoacoustic imaging.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».